Protein–RNA interactions for Protein: O95178

NDUFB2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB2O95178 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFB2O95178 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFB2O95178 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFB2O95178 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFB2O95178 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFB2O95178 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFB2O95178 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFB2O95178 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDUFB2O95178 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NDUFB2O95178 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDUFB2O95178 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFB2O95178 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFB2O95178 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFB2O95178 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFB2O95178 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFB2O95178 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFB2O95178 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFB2O95178 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFB2O95178 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFB2O95178 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFB2O95178 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFB2O95178 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFB2O95178 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFB2O95178 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFB2O95178 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFB2O95178 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFB2O95178 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NDUFB2O95178 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFB2O95178 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFB2O95178 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFB2O95178 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFB2O95178 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFB2O95178 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFB2O95178 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFB2O95178 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFB2O95178 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFB2O95178 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFB2O95178 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFB2O95178 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFB2O95178 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFB2O95178 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFB2O95178 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFB2O95178 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFB2O95178 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFB2O95178 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFB2O95178 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFB2O95178 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFB2O95178 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFB2O95178 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFB2O95178 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFB2O95178 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFB2O95178 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFB2O95178 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFB2O95178 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFB2O95178 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFB2O95178 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFB2O95178 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFB2O95178 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFB2O95178 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFB2O95178 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NDUFB2O95178 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NDUFB2O95178 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFB2O95178 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFB2O95178 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDUFB2O95178 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDUFB2O95178 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NDUFB2O95178 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFB2O95178 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFB2O95178 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFB2O95178 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFB2O95178 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFB2O95178 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFB2O95178 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFB2O95178 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFB2O95178 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFB2O95178 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFB2O95178 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFB2O95178 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFB2O95178 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFB2O95178 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFB2O95178 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFB2O95178 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFB2O95178 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFB2O95178 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFB2O95178 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFB2O95178 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFB2O95178 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFB2O95178 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFB2O95178 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFB2O95178 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFB2O95178 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms