Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRCPO75575 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRCPO75575 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRCPO75575 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRCPO75575 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRCPO75575 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRCPO75575 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRCPO75575 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRCPO75575 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRCPO75575 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRCPO75575 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CRCPO75575 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRCPO75575 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRCPO75575 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRCPO75575 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRCPO75575 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRCPO75575 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRCPO75575 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRCPO75575 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRCPO75575 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRCPO75575 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CRCPO75575 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CRCPO75575 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CRCPO75575 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRCPO75575 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRCPO75575 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRCPO75575 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRCPO75575 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRCPO75575 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRCPO75575 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRCPO75575 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRCPO75575 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRCPO75575 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRCPO75575 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRCPO75575 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRCPO75575 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CRCPO75575 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRCPO75575 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRCPO75575 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRCPO75575 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRCPO75575 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRCPO75575 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRCPO75575 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRCPO75575 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRCPO75575 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRCPO75575 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRCPO75575 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CRCPO75575 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRCPO75575 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRCPO75575 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRCPO75575 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRCPO75575 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRCPO75575 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRCPO75575 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CRCPO75575 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRCPO75575 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRCPO75575 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRCPO75575 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRCPO75575 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRCPO75575 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRCPO75575 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRCPO75575 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRCPO75575 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRCPO75575 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRCPO75575 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRCPO75575 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRCPO75575 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRCPO75575 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRCPO75575 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRCPO75575 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRCPO75575 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRCPO75575 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CRCPO75575 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRCPO75575 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRCPO75575 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRCPO75575 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRCPO75575 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRCPO75575 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CRCPO75575 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CRCPO75575 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRCPO75575 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRCPO75575 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRCPO75575 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRCPO75575 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRCPO75575 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRCPO75575 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRCPO75575 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRCPO75575 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRCPO75575 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRCPO75575 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRCPO75575 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRCPO75575 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRCPO75575 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRCPO75575 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRCPO75575 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRCPO75575 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRCPO75575 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRCPO75575 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRCPO75575 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRCPO75575 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms