Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKAP2O75563 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKAP2O75563 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP2O75563 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP2O75563 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP2O75563 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP2O75563 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKAP2O75563 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKAP2O75563 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKAP2O75563 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SKAP2O75563 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKAP2O75563 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKAP2O75563 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKAP2O75563 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKAP2O75563 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP2O75563 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP2O75563 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKAP2O75563 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKAP2O75563 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKAP2O75563 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP2O75563 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP2O75563 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP2O75563 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP2O75563 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP2O75563 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP2O75563 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP2O75563 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKAP2O75563 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKAP2O75563 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKAP2O75563 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKAP2O75563 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SKAP2O75563 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP2O75563 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP2O75563 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP2O75563 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP2O75563 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP2O75563 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP2O75563 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP2O75563 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP2O75563 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP2O75563 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKAP2O75563 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKAP2O75563 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKAP2O75563 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKAP2O75563 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKAP2O75563 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKAP2O75563 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKAP2O75563 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKAP2O75563 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKAP2O75563 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKAP2O75563 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP2O75563 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP2O75563 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKAP2O75563 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKAP2O75563 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKAP2O75563 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKAP2O75563 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP2O75563 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP2O75563 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP2O75563 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP2O75563 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP2O75563 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP2O75563 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms