Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSO75390 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSO75390 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSO75390 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSO75390 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSO75390 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSO75390 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CSO75390 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSO75390 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSO75390 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSO75390 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CSO75390 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSO75390 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSO75390 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSO75390 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSO75390 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSO75390 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSO75390 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSO75390 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSO75390 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CSO75390 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSO75390 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSO75390 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CSO75390 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CSO75390 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSO75390 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSO75390 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSO75390 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSO75390 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CSO75390 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSO75390 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CSO75390 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSO75390 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSO75390 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSO75390 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSO75390 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSO75390 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSO75390 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CSO75390 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSO75390 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSO75390 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSO75390 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSO75390 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSO75390 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSO75390 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSO75390 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSO75390 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSO75390 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSO75390 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSO75390 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSO75390 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSO75390 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSO75390 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSO75390 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSO75390 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CSO75390 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CSO75390 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CSO75390 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSO75390 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSO75390 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSO75390 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSO75390 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSO75390 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSO75390 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSO75390 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSO75390 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSO75390 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSO75390 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSO75390 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSO75390 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSO75390 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSO75390 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSO75390 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSO75390 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSO75390 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSO75390 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSO75390 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSO75390 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CSO75390 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CSO75390 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CSO75390 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CSO75390 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSO75390 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSO75390 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSO75390 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSO75390 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSO75390 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSO75390 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CSO75390 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSO75390 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSO75390 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSO75390 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSO75390 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSO75390 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSO75390 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSO75390 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSO75390 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSO75390 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSO75390 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSO75390 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms