Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTN2O75298 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTN2O75298 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTN2O75298 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTN2O75298 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RTN2O75298 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTN2O75298 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTN2O75298 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTN2O75298 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTN2O75298 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTN2O75298 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTN2O75298 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTN2O75298 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RTN2O75298 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTN2O75298 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RTN2O75298 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RTN2O75298 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTN2O75298 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RTN2O75298 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTN2O75298 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTN2O75298 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTN2O75298 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTN2O75298 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTN2O75298 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTN2O75298 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTN2O75298 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTN2O75298 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTN2O75298 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTN2O75298 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTN2O75298 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTN2O75298 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTN2O75298 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN2O75298 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN2O75298 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN2O75298 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTN2O75298 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RTN2O75298 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTN2O75298 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTN2O75298 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTN2O75298 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTN2O75298 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTN2O75298 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTN2O75298 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTN2O75298 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTN2O75298 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RTN2O75298 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RTN2O75298 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTN2O75298 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTN2O75298 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTN2O75298 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTN2O75298 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTN2O75298 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTN2O75298 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RTN2O75298 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTN2O75298 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTN2O75298 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTN2O75298 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTN2O75298 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTN2O75298 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTN2O75298 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTN2O75298 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTN2O75298 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTN2O75298 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTN2O75298 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTN2O75298 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTN2O75298 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTN2O75298 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTN2O75298 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTN2O75298 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN2O75298 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN2O75298 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN2O75298 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN2O75298 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN2O75298 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN2O75298 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTN2O75298 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTN2O75298 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTN2O75298 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTN2O75298 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTN2O75298 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTN2O75298 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTN2O75298 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN2O75298 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN2O75298 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTN2O75298 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTN2O75298 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTN2O75298 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN2O75298 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN2O75298 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN2O75298 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN2O75298 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN2O75298 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTN2O75298 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTN2O75298 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RTN2O75298 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTN2O75298 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTN2O75298 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN2O75298 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTN2O75298 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTN2O75298 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms