Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPOPO43791 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPOPO43791 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPOPO43791 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SPOPO43791 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SPOPO43791 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPOPO43791 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPOPO43791 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPOPO43791 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPOPO43791 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPOPO43791 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPOPO43791 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPOPO43791 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPOPO43791 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPOPO43791 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPOPO43791 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPOPO43791 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPOPO43791 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPOPO43791 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SPOPO43791 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SPOPO43791 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SPOPO43791 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPOPO43791 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SPOPO43791 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPOPO43791 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPOPO43791 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPOPO43791 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPOPO43791 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPOPO43791 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPOPO43791 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPOPO43791 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPOPO43791 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPOPO43791 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPOPO43791 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPOPO43791 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPOPO43791 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPOPO43791 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPOPO43791 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPOPO43791 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPOPO43791 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPOPO43791 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPOPO43791 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPOPO43791 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPOPO43791 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPOPO43791 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPOPO43791 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPOPO43791 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPOPO43791 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPOPO43791 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPOPO43791 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPOPO43791 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPOPO43791 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPOPO43791 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPOPO43791 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPOPO43791 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPOPO43791 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPOPO43791 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPOPO43791 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPOPO43791 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPOPO43791 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPOPO43791 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPOPO43791 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPOPO43791 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPOPO43791 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPOPO43791 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPOPO43791 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPOPO43791 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPOPO43791 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPOPO43791 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPOPO43791 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPOPO43791 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SPOPO43791 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPOPO43791 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPOPO43791 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPOPO43791 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPOPO43791 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPOPO43791 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPOPO43791 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPOPO43791 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SPOPO43791 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPOPO43791 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPOPO43791 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPOPO43791 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPOPO43791 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPOPO43791 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPOPO43791 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPOPO43791 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPOPO43791 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPOPO43791 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPOPO43791 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPOPO43791 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPOPO43791 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPOPO43791 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPOPO43791 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPOPO43791 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPOPO43791 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPOPO43791 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPOPO43791 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPOPO43791 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPOPO43791 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms