Protein–RNA interactions for Protein: O14497

ARID1A, AT-rich interactive domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 2,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1AO14497 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID1AO14497 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID1AO14497 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID1AO14497 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID1AO14497 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID1AO14497 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARID1AO14497 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID1AO14497 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID1AO14497 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID1AO14497 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID1AO14497 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID1AO14497 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID1AO14497 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID1AO14497 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID1AO14497 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID1AO14497 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID1AO14497 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID1AO14497 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID1AO14497 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID1AO14497 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID1AO14497 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID1AO14497 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID1AO14497 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID1AO14497 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID1AO14497 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID1AO14497 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID1AO14497 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID1AO14497 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID1AO14497 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID1AO14497 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID1AO14497 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID1AO14497 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID1AO14497 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID1AO14497 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID1AO14497 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID1AO14497 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID1AO14497 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID1AO14497 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID1AO14497 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID1AO14497 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID1AO14497 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID1AO14497 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID1AO14497 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms