Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH2

KDM4E, Lysine-specific demethylase 4E, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4EB2RXH2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM4EB2RXH2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM4EB2RXH2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM4EB2RXH2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM4EB2RXH2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4EB2RXH2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4EB2RXH2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4EB2RXH2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4EB2RXH2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM4EB2RXH2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM4EB2RXH2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM4EB2RXH2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM4EB2RXH2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4EB2RXH2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4EB2RXH2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM4EB2RXH2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM4EB2RXH2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM4EB2RXH2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4EB2RXH2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4EB2RXH2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4EB2RXH2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM4EB2RXH2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM4EB2RXH2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM4EB2RXH2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM4EB2RXH2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM4EB2RXH2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM4EB2RXH2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM4EB2RXH2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM4EB2RXH2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM4EB2RXH2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM4EB2RXH2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4EB2RXH2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4EB2RXH2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4EB2RXH2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4EB2RXH2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4EB2RXH2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM4EB2RXH2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4EB2RXH2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4EB2RXH2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4EB2RXH2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4EB2RXH2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM4EB2RXH2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM4EB2RXH2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM4EB2RXH2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM4EB2RXH2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM4EB2RXH2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM4EB2RXH2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM4EB2RXH2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM4EB2RXH2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM4EB2RXH2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM4EB2RXH2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM4EB2RXH2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM4EB2RXH2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM4EB2RXH2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM4EB2RXH2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM4EB2RXH2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM4EB2RXH2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM4EB2RXH2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM4EB2RXH2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM4EB2RXH2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM4EB2RXH2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM4EB2RXH2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM4EB2RXH2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM4EB2RXH2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4EB2RXH2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4EB2RXH2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4EB2RXH2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4EB2RXH2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4EB2RXH2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4EB2RXH2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4EB2RXH2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4EB2RXH2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4EB2RXH2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4EB2RXH2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4EB2RXH2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4EB2RXH2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4EB2RXH2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM4EB2RXH2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4EB2RXH2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms