Protein–RNA interactions for Protein: A1X283

SH3PXD2B, SH3 and PX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3PXD2BA1X283 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3PXD2BA1X283 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3PXD2BA1X283 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3PXD2BA1X283 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3PXD2BA1X283 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3PXD2BA1X283 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3PXD2BA1X283 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3PXD2BA1X283 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3PXD2BA1X283 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3PXD2BA1X283 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3PXD2BA1X283 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3PXD2BA1X283 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3PXD2BA1X283 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3PXD2BA1X283 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH3PXD2BA1X283 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH3PXD2BA1X283 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3PXD2BA1X283 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3PXD2BA1X283 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3PXD2BA1X283 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3PXD2BA1X283 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3PXD2BA1X283 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3PXD2BA1X283 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3PXD2BA1X283 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3PXD2BA1X283 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3PXD2BA1X283 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3PXD2BA1X283 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3PXD2BA1X283 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3PXD2BA1X283 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3PXD2BA1X283 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3PXD2BA1X283 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3PXD2BA1X283 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3PXD2BA1X283 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3PXD2BA1X283 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3PXD2BA1X283 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3PXD2BA1X283 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3PXD2BA1X283 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3PXD2BA1X283 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3PXD2BA1X283 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3PXD2BA1X283 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3PXD2BA1X283 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3PXD2BA1X283 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3PXD2BA1X283 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3PXD2BA1X283 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3PXD2BA1X283 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3PXD2BA1X283 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3PXD2BA1X283 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3PXD2BA1X283 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3PXD2BA1X283 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3PXD2BA1X283 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3PXD2BA1X283 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3PXD2BA1X283 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3PXD2BA1X283 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3PXD2BA1X283 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3PXD2BA1X283 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3PXD2BA1X283 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3PXD2BA1X283 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3PXD2BA1X283 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3PXD2BA1X283 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3PXD2BA1X283 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3PXD2BA1X283 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3PXD2BA1X283 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3PXD2BA1X283 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3PXD2BA1X283 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3PXD2BA1X283 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3PXD2BA1X283 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3PXD2BA1X283 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3PXD2BA1X283 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3PXD2BA1X283 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3PXD2BA1X283 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3PXD2BA1X283 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3PXD2BA1X283 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3PXD2BA1X283 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3PXD2BA1X283 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3PXD2BA1X283 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3PXD2BA1X283 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3PXD2BA1X283 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3PXD2BA1X283 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3PXD2BA1X283 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3PXD2BA1X283 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3PXD2BA1X283 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms