Protein–RNA interactions for Protein: A0A096LPE2

SAA2-SAA4, SAA2-SAA4 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2-SAA4A0A096LPE2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAA2-SAA4A0A096LPE2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAA2-SAA4A0A096LPE2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAA2-SAA4A0A096LPE2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAA2-SAA4A0A096LPE2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAA2-SAA4A0A096LPE2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAA2-SAA4A0A096LPE2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAA2-SAA4A0A096LPE2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAA2-SAA4A0A096LPE2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAA2-SAA4A0A096LPE2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAA2-SAA4A0A096LPE2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAA2-SAA4A0A096LPE2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAA2-SAA4A0A096LPE2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAA2-SAA4A0A096LPE2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAA2-SAA4A0A096LPE2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAA2-SAA4A0A096LPE2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAA2-SAA4A0A096LPE2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAA2-SAA4A0A096LPE2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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SAA2-SAA4A0A096LPE2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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SAA2-SAA4A0A096LPE2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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SAA2-SAA4A0A096LPE2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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SAA2-SAA4A0A096LPE2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAA2-SAA4A0A096LPE2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SAA2-SAA4A0A096LPE2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAA2-SAA4A0A096LPE2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAA2-SAA4A0A096LPE2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAA2-SAA4A0A096LPE2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAA2-SAA4A0A096LPE2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAA2-SAA4A0A096LPE2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAA2-SAA4A0A096LPE2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAA2-SAA4A0A096LPE2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
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SAA2-SAA4A0A096LPE2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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SAA2-SAA4A0A096LPE2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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SAA2-SAA4A0A096LPE2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAA2-SAA4A0A096LPE2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAA2-SAA4A0A096LPE2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAA2-SAA4A0A096LPE2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAA2-SAA4A0A096LPE2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAA2-SAA4A0A096LPE2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAA2-SAA4A0A096LPE2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAA2-SAA4A0A096LPE2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAA2-SAA4A0A096LPE2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAA2-SAA4A0A096LPE2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAA2-SAA4A0A096LPE2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAA2-SAA4A0A096LPE2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAA2-SAA4A0A096LPE2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SAA2-SAA4A0A096LPE2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAA2-SAA4A0A096LPE2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAA2-SAA4A0A096LPE2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAA2-SAA4A0A096LPE2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAA2-SAA4A0A096LPE2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAA2-SAA4A0A096LPE2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAA2-SAA4A0A096LPE2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAA2-SAA4A0A096LPE2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAA2-SAA4A0A096LPE2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAA2-SAA4A0A096LPE2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAA2-SAA4A0A096LPE2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAA2-SAA4A0A096LPE2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAA2-SAA4A0A096LPE2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAA2-SAA4A0A096LPE2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAA2-SAA4A0A096LPE2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAA2-SAA4A0A096LPE2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAA2-SAA4A0A096LPE2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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