Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H8

IGKV1D-42, Immunoglobulin kappa variable 1D-42 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-42A0A075B6H8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGKV1D-42A0A075B6H8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGKV1D-42A0A075B6H8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGKV1D-42A0A075B6H8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGKV1D-42A0A075B6H8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGKV1D-42A0A075B6H8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGKV1D-42A0A075B6H8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGKV1D-42A0A075B6H8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGKV1D-42A0A075B6H8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGKV1D-42A0A075B6H8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGKV1D-42A0A075B6H8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGKV1D-42A0A075B6H8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGKV1D-42A0A075B6H8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGKV1D-42A0A075B6H8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGKV1D-42A0A075B6H8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGKV1D-42A0A075B6H8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IGKV1D-42A0A075B6H8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGKV1D-42A0A075B6H8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGKV1D-42A0A075B6H8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGKV1D-42A0A075B6H8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGKV1D-42A0A075B6H8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGKV1D-42A0A075B6H8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IGKV1D-42A0A075B6H8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGKV1D-42A0A075B6H8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGKV1D-42A0A075B6H8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms