Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC4Q9Y296 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC4Q9Y296 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC4Q9Y296 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC4Q9Y296 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC4Q9Y296 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC4Q9Y296 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC4Q9Y296 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC4Q9Y296 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC4Q9Y296 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC4Q9Y296 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC4Q9Y296 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC4Q9Y296 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC4Q9Y296 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC4Q9Y296 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC4Q9Y296 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC4Q9Y296 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC4Q9Y296 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC4Q9Y296 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC4Q9Y296 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC4Q9Y296 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC4Q9Y296 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC4Q9Y296 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC4Q9Y296 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC4Q9Y296 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC4Q9Y296 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC4Q9Y296 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC4Q9Y296 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC4Q9Y296 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC4Q9Y296 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC4Q9Y296 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC4Q9Y296 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC4Q9Y296 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC4Q9Y296 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC4Q9Y296 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC4Q9Y296 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC4Q9Y296 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC4Q9Y296 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC4Q9Y296 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC4Q9Y296 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC4Q9Y296 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC4Q9Y296 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC4Q9Y296 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC4Q9Y296 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC4Q9Y296 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC4Q9Y296 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC4Q9Y296 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC4Q9Y296 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC4Q9Y296 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC4Q9Y296 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC4Q9Y296 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC4Q9Y296 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC4Q9Y296 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC4Q9Y296 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC4Q9Y296 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC4Q9Y296 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC4Q9Y296 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC4Q9Y296 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC4Q9Y296 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC4Q9Y296 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC4Q9Y296 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC4Q9Y296 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC4Q9Y296 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC4Q9Y296 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC4Q9Y296 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC4Q9Y296 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC4Q9Y296 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC4Q9Y296 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC4Q9Y296 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC4Q9Y296 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC4Q9Y296 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC4Q9Y296 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC4Q9Y296 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC4Q9Y296 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAPPC4Q9Y296 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC4Q9Y296 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC4Q9Y296 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms