Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQV4

LAMP3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP3Q9UQV4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMP3Q9UQV4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP3Q9UQV4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP3Q9UQV4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP3Q9UQV4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP3Q9UQV4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP3Q9UQV4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP3Q9UQV4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMP3Q9UQV4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMP3Q9UQV4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMP3Q9UQV4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP3Q9UQV4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP3Q9UQV4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMP3Q9UQV4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMP3Q9UQV4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMP3Q9UQV4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMP3Q9UQV4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMP3Q9UQV4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMP3Q9UQV4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMP3Q9UQV4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP3Q9UQV4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMP3Q9UQV4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMP3Q9UQV4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMP3Q9UQV4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMP3Q9UQV4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMP3Q9UQV4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMP3Q9UQV4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMP3Q9UQV4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMP3Q9UQV4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMP3Q9UQV4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMP3Q9UQV4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMP3Q9UQV4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMP3Q9UQV4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP3Q9UQV4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP3Q9UQV4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP3Q9UQV4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP3Q9UQV4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP3Q9UQV4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP3Q9UQV4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMP3Q9UQV4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMP3Q9UQV4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMP3Q9UQV4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMP3Q9UQV4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMP3Q9UQV4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMP3Q9UQV4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMP3Q9UQV4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMP3Q9UQV4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMP3Q9UQV4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMP3Q9UQV4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMP3Q9UQV4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMP3Q9UQV4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMP3Q9UQV4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMP3Q9UQV4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMP3Q9UQV4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMP3Q9UQV4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMP3Q9UQV4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMP3Q9UQV4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMP3Q9UQV4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMP3Q9UQV4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMP3Q9UQV4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms