Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ35

SRRM2, Serine/arginine repetitive matrix protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM2Q9UQ35 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRM2Q9UQ35 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRM2Q9UQ35 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRRM2Q9UQ35 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRM2Q9UQ35 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRM2Q9UQ35 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRM2Q9UQ35 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRM2Q9UQ35 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRM2Q9UQ35 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRM2Q9UQ35 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRM2Q9UQ35 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRRM2Q9UQ35 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRM2Q9UQ35 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRM2Q9UQ35 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRM2Q9UQ35 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRRM2Q9UQ35 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRM2Q9UQ35 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRM2Q9UQ35 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRRM2Q9UQ35 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRM2Q9UQ35 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRRM2Q9UQ35 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM2Q9UQ35 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM2Q9UQ35 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM2Q9UQ35 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM2Q9UQ35 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRRM2Q9UQ35 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM2Q9UQ35 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRRM2Q9UQ35 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM2Q9UQ35 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM2Q9UQ35 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM2Q9UQ35 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRRM2Q9UQ35 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM2Q9UQ35 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM2Q9UQ35 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM2Q9UQ35 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM2Q9UQ35 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM2Q9UQ35 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM2Q9UQ35 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM2Q9UQ35 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM2Q9UQ35 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM2Q9UQ35 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM2Q9UQ35 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM2Q9UQ35 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM2Q9UQ35 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRM2Q9UQ35 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRM2Q9UQ35 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRM2Q9UQ35 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRM2Q9UQ35 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRM2Q9UQ35 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRM2Q9UQ35 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRM2Q9UQ35 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRRM2Q9UQ35 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRRM2Q9UQ35 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRRM2Q9UQ35 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRRM2Q9UQ35 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms