Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A1LQ9UNN4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A1LQ9UNN4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A1LQ9UNN4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A1LQ9UNN4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A1LQ9UNN4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A1LQ9UNN4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A1LQ9UNN4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A1LQ9UNN4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A1LQ9UNN4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A1LQ9UNN4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A1LQ9UNN4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A1LQ9UNN4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2A1LQ9UNN4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A1LQ9UNN4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A1LQ9UNN4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2A1LQ9UNN4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2A1LQ9UNN4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A1LQ9UNN4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A1LQ9UNN4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2A1LQ9UNN4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2A1LQ9UNN4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2A1LQ9UNN4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A1LQ9UNN4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A1LQ9UNN4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A1LQ9UNN4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A1LQ9UNN4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A1LQ9UNN4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A1LQ9UNN4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A1LQ9UNN4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A1LQ9UNN4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A1LQ9UNN4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A1LQ9UNN4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A1LQ9UNN4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A1LQ9UNN4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A1LQ9UNN4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A1LQ9UNN4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A1LQ9UNN4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A1LQ9UNN4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A1LQ9UNN4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A1LQ9UNN4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A1LQ9UNN4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A1LQ9UNN4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A1LQ9UNN4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A1LQ9UNN4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A1LQ9UNN4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A1LQ9UNN4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A1LQ9UNN4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A1LQ9UNN4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A1LQ9UNN4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A1LQ9UNN4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2A1LQ9UNN4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A1LQ9UNN4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A1LQ9UNN4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A1LQ9UNN4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A1LQ9UNN4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A1LQ9UNN4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2A1LQ9UNN4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A1LQ9UNN4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A1LQ9UNN4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A1LQ9UNN4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A1LQ9UNN4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A1LQ9UNN4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A1LQ9UNN4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A1LQ9UNN4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A1LQ9UNN4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A1LQ9UNN4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A1LQ9UNN4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2A1LQ9UNN4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2A1LQ9UNN4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A1LQ9UNN4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A1LQ9UNN4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A1LQ9UNN4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A1LQ9UNN4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A1LQ9UNN4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A1LQ9UNN4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A1LQ9UNN4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A1LQ9UNN4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A1LQ9UNN4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2A1LQ9UNN4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A1LQ9UNN4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2A1LQ9UNN4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2A1LQ9UNN4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2A1LQ9UNN4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2A1LQ9UNN4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2A1LQ9UNN4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A1LQ9UNN4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A1LQ9UNN4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A1LQ9UNN4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A1LQ9UNN4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A1LQ9UNN4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A1LQ9UNN4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A1LQ9UNN4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A1LQ9UNN4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A1LQ9UNN4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A1LQ9UNN4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A1LQ9UNN4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms