Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RCAN3Q9UKA8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RCAN3Q9UKA8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RCAN3Q9UKA8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RCAN3Q9UKA8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RCAN3Q9UKA8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RCAN3Q9UKA8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RCAN3Q9UKA8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
RCAN3Q9UKA8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RCAN3Q9UKA8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RCAN3Q9UKA8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RCAN3Q9UKA8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RCAN3Q9UKA8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RCAN3Q9UKA8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RCAN3Q9UKA8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RCAN3Q9UKA8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RCAN3Q9UKA8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RCAN3Q9UKA8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RCAN3Q9UKA8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RCAN3Q9UKA8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RCAN3Q9UKA8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RCAN3Q9UKA8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RCAN3Q9UKA8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RCAN3Q9UKA8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RCAN3Q9UKA8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RCAN3Q9UKA8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RCAN3Q9UKA8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RCAN3Q9UKA8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RCAN3Q9UKA8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RCAN3Q9UKA8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RCAN3Q9UKA8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RCAN3Q9UKA8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RCAN3Q9UKA8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RCAN3Q9UKA8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RCAN3Q9UKA8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
RCAN3Q9UKA8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RCAN3Q9UKA8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
RCAN3Q9UKA8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RCAN3Q9UKA8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RCAN3Q9UKA8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RCAN3Q9UKA8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RCAN3Q9UKA8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RCAN3Q9UKA8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RCAN3Q9UKA8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RCAN3Q9UKA8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RCAN3Q9UKA8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RCAN3Q9UKA8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RCAN3Q9UKA8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RCAN3Q9UKA8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RCAN3Q9UKA8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RCAN3Q9UKA8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RCAN3Q9UKA8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RCAN3Q9UKA8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
RCAN3Q9UKA8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RCAN3Q9UKA8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RCAN3Q9UKA8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RCAN3Q9UKA8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
RCAN3Q9UKA8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RCAN3Q9UKA8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RCAN3Q9UKA8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RCAN3Q9UKA8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RCAN3Q9UKA8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RCAN3Q9UKA8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RCAN3Q9UKA8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RCAN3Q9UKA8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RCAN3Q9UKA8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
RCAN3Q9UKA8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RCAN3Q9UKA8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RCAN3Q9UKA8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RCAN3Q9UKA8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
RCAN3Q9UKA8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RCAN3Q9UKA8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RCAN3Q9UKA8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RCAN3Q9UKA8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RCAN3Q9UKA8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
RCAN3Q9UKA8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RCAN3Q9UKA8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RCAN3Q9UKA8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RCAN3Q9UKA8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RCAN3Q9UKA8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RCAN3Q9UKA8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RCAN3Q9UKA8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RCAN3Q9UKA8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RCAN3Q9UKA8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RCAN3Q9UKA8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RCAN3Q9UKA8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RCAN3Q9UKA8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RCAN3Q9UKA8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RCAN3Q9UKA8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RCAN3Q9UKA8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RCAN3Q9UKA8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RCAN3Q9UKA8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RCAN3Q9UKA8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
RCAN3Q9UKA8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
RCAN3Q9UKA8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RCAN3Q9UKA8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RCAN3Q9UKA8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RCAN3Q9UKA8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RCAN3Q9UKA8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RCAN3Q9UKA8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms