Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GGA2Q9UJY4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GGA2Q9UJY4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GGA2Q9UJY4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GGA2Q9UJY4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GGA2Q9UJY4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GGA2Q9UJY4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GGA2Q9UJY4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GGA2Q9UJY4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GGA2Q9UJY4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GGA2Q9UJY4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GGA2Q9UJY4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GGA2Q9UJY4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GGA2Q9UJY4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GGA2Q9UJY4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GGA2Q9UJY4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GGA2Q9UJY4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GGA2Q9UJY4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GGA2Q9UJY4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GGA2Q9UJY4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GGA2Q9UJY4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GGA2Q9UJY4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGA2Q9UJY4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGA2Q9UJY4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGA2Q9UJY4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGA2Q9UJY4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GGA2Q9UJY4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGA2Q9UJY4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA2Q9UJY4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGA2Q9UJY4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGA2Q9UJY4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGA2Q9UJY4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGA2Q9UJY4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGA2Q9UJY4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GGA2Q9UJY4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GGA2Q9UJY4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA2Q9UJY4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA2Q9UJY4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA2Q9UJY4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA2Q9UJY4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GGA2Q9UJY4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GGA2Q9UJY4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGA2Q9UJY4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGA2Q9UJY4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGA2Q9UJY4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GGA2Q9UJY4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GGA2Q9UJY4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA2Q9UJY4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA2Q9UJY4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GGA2Q9UJY4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GGA2Q9UJY4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GGA2Q9UJY4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GGA2Q9UJY4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GGA2Q9UJY4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GGA2Q9UJY4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GGA2Q9UJY4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GGA2Q9UJY4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GGA2Q9UJY4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GGA2Q9UJY4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GGA2Q9UJY4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GGA2Q9UJY4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GGA2Q9UJY4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GGA2Q9UJY4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GGA2Q9UJY4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GGA2Q9UJY4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GGA2Q9UJY4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GGA2Q9UJY4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GGA2Q9UJY4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GGA2Q9UJY4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GGA2Q9UJY4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GGA2Q9UJY4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GGA2Q9UJY4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
GGA2Q9UJY4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GGA2Q9UJY4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGA2Q9UJY4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGA2Q9UJY4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGA2Q9UJY4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GGA2Q9UJY4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GGA2Q9UJY4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GGA2Q9UJY4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GGA2Q9UJY4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GGA2Q9UJY4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GGA2Q9UJY4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GGA2Q9UJY4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GGA2Q9UJY4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GGA2Q9UJY4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GGA2Q9UJY4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GGA2Q9UJY4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GGA2Q9UJY4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GGA2Q9UJY4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GGA2Q9UJY4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GGA2Q9UJY4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GGA2Q9UJY4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GGA2Q9UJY4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GGA2Q9UJY4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGA2Q9UJY4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GGA2Q9UJY4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GGA2Q9UJY4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGA2Q9UJY4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GGA2Q9UJY4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms