Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUFIP1Q9UHK0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUFIP1Q9UHK0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUFIP1Q9UHK0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUFIP1Q9UHK0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUFIP1Q9UHK0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUFIP1Q9UHK0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUFIP1Q9UHK0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUFIP1Q9UHK0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUFIP1Q9UHK0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUFIP1Q9UHK0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUFIP1Q9UHK0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUFIP1Q9UHK0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUFIP1Q9UHK0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUFIP1Q9UHK0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUFIP1Q9UHK0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUFIP1Q9UHK0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUFIP1Q9UHK0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NUFIP1Q9UHK0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUFIP1Q9UHK0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUFIP1Q9UHK0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUFIP1Q9UHK0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUFIP1Q9UHK0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUFIP1Q9UHK0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUFIP1Q9UHK0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUFIP1Q9UHK0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUFIP1Q9UHK0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUFIP1Q9UHK0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUFIP1Q9UHK0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUFIP1Q9UHK0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUFIP1Q9UHK0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUFIP1Q9UHK0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUFIP1Q9UHK0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUFIP1Q9UHK0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUFIP1Q9UHK0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUFIP1Q9UHK0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUFIP1Q9UHK0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUFIP1Q9UHK0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUFIP1Q9UHK0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUFIP1Q9UHK0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUFIP1Q9UHK0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUFIP1Q9UHK0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUFIP1Q9UHK0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUFIP1Q9UHK0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUFIP1Q9UHK0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUFIP1Q9UHK0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUFIP1Q9UHK0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUFIP1Q9UHK0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NUFIP1Q9UHK0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUFIP1Q9UHK0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUFIP1Q9UHK0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUFIP1Q9UHK0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUFIP1Q9UHK0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUFIP1Q9UHK0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUFIP1Q9UHK0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUFIP1Q9UHK0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUFIP1Q9UHK0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUFIP1Q9UHK0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUFIP1Q9UHK0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUFIP1Q9UHK0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUFIP1Q9UHK0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NUFIP1Q9UHK0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUFIP1Q9UHK0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUFIP1Q9UHK0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUFIP1Q9UHK0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUFIP1Q9UHK0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUFIP1Q9UHK0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUFIP1Q9UHK0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUFIP1Q9UHK0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUFIP1Q9UHK0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUFIP1Q9UHK0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUFIP1Q9UHK0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUFIP1Q9UHK0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUFIP1Q9UHK0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUFIP1Q9UHK0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUFIP1Q9UHK0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUFIP1Q9UHK0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUFIP1Q9UHK0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUFIP1Q9UHK0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUFIP1Q9UHK0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUFIP1Q9UHK0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUFIP1Q9UHK0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUFIP1Q9UHK0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUFIP1Q9UHK0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUFIP1Q9UHK0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUFIP1Q9UHK0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUFIP1Q9UHK0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUFIP1Q9UHK0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUFIP1Q9UHK0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUFIP1Q9UHK0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUFIP1Q9UHK0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUFIP1Q9UHK0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NUFIP1Q9UHK0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUFIP1Q9UHK0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUFIP1Q9UHK0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUFIP1Q9UHK0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUFIP1Q9UHK0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUFIP1Q9UHK0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUFIP1Q9UHK0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUFIP1Q9UHK0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms