Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3KQ9UBQ5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3KQ9UBQ5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3KQ9UBQ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3KQ9UBQ5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3KQ9UBQ5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3KQ9UBQ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EIF3KQ9UBQ5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3KQ9UBQ5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3KQ9UBQ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3KQ9UBQ5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3KQ9UBQ5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3KQ9UBQ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3KQ9UBQ5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3KQ9UBQ5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3KQ9UBQ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3KQ9UBQ5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3KQ9UBQ5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3KQ9UBQ5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3KQ9UBQ5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3KQ9UBQ5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3KQ9UBQ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3KQ9UBQ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3KQ9UBQ5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3KQ9UBQ5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3KQ9UBQ5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3KQ9UBQ5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3KQ9UBQ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3KQ9UBQ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3KQ9UBQ5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3KQ9UBQ5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3KQ9UBQ5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3KQ9UBQ5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EIF3KQ9UBQ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3KQ9UBQ5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3KQ9UBQ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3KQ9UBQ5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3KQ9UBQ5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3KQ9UBQ5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3KQ9UBQ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3KQ9UBQ5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3KQ9UBQ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3KQ9UBQ5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3KQ9UBQ5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3KQ9UBQ5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3KQ9UBQ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3KQ9UBQ5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3KQ9UBQ5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3KQ9UBQ5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3KQ9UBQ5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3KQ9UBQ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3KQ9UBQ5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3KQ9UBQ5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3KQ9UBQ5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3KQ9UBQ5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3KQ9UBQ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3KQ9UBQ5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3KQ9UBQ5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3KQ9UBQ5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3KQ9UBQ5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3KQ9UBQ5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3KQ9UBQ5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3KQ9UBQ5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3KQ9UBQ5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3KQ9UBQ5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3KQ9UBQ5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3KQ9UBQ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3KQ9UBQ5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3KQ9UBQ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3KQ9UBQ5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3KQ9UBQ5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3KQ9UBQ5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF3KQ9UBQ5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF3KQ9UBQ5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3KQ9UBQ5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3KQ9UBQ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3KQ9UBQ5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3KQ9UBQ5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3KQ9UBQ5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3KQ9UBQ5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3KQ9UBQ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3KQ9UBQ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3KQ9UBQ5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3KQ9UBQ5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3KQ9UBQ5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3KQ9UBQ5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3KQ9UBQ5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3KQ9UBQ5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3KQ9UBQ5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3KQ9UBQ5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3KQ9UBQ5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EIF3KQ9UBQ5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3KQ9UBQ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3KQ9UBQ5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3KQ9UBQ5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3KQ9UBQ5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3KQ9UBQ5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3KQ9UBQ5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3KQ9UBQ5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3KQ9UBQ5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms