Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAP2Q9NVZ3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAP2Q9NVZ3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAP2Q9NVZ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAP2Q9NVZ3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAP2Q9NVZ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAP2Q9NVZ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAP2Q9NVZ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAP2Q9NVZ3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAP2Q9NVZ3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAP2Q9NVZ3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAP2Q9NVZ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAP2Q9NVZ3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAP2Q9NVZ3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAP2Q9NVZ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAP2Q9NVZ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECAP2Q9NVZ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECAP2Q9NVZ3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECAP2Q9NVZ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECAP2Q9NVZ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECAP2Q9NVZ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECAP2Q9NVZ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECAP2Q9NVZ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECAP2Q9NVZ3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECAP2Q9NVZ3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECAP2Q9NVZ3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECAP2Q9NVZ3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECAP2Q9NVZ3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECAP2Q9NVZ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECAP2Q9NVZ3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECAP2Q9NVZ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECAP2Q9NVZ3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECAP2Q9NVZ3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECAP2Q9NVZ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECAP2Q9NVZ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECAP2Q9NVZ3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECAP2Q9NVZ3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECAP2Q9NVZ3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECAP2Q9NVZ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECAP2Q9NVZ3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECAP2Q9NVZ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECAP2Q9NVZ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECAP2Q9NVZ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECAP2Q9NVZ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECAP2Q9NVZ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECAP2Q9NVZ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECAP2Q9NVZ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NECAP2Q9NVZ3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECAP2Q9NVZ3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECAP2Q9NVZ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECAP2Q9NVZ3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECAP2Q9NVZ3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECAP2Q9NVZ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECAP2Q9NVZ3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECAP2Q9NVZ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECAP2Q9NVZ3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECAP2Q9NVZ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECAP2Q9NVZ3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECAP2Q9NVZ3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECAP2Q9NVZ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NECAP2Q9NVZ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECAP2Q9NVZ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECAP2Q9NVZ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECAP2Q9NVZ3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECAP2Q9NVZ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECAP2Q9NVZ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECAP2Q9NVZ3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECAP2Q9NVZ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECAP2Q9NVZ3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECAP2Q9NVZ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NECAP2Q9NVZ3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECAP2Q9NVZ3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECAP2Q9NVZ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECAP2Q9NVZ3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAP2Q9NVZ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAP2Q9NVZ3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAP2Q9NVZ3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAP2Q9NVZ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAP2Q9NVZ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAP2Q9NVZ3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms