Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIC8BQ9NVN3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIC8BQ9NVN3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIC8BQ9NVN3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RIC8BQ9NVN3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIC8BQ9NVN3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIC8BQ9NVN3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIC8BQ9NVN3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIC8BQ9NVN3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIC8BQ9NVN3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIC8BQ9NVN3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIC8BQ9NVN3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIC8BQ9NVN3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIC8BQ9NVN3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIC8BQ9NVN3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RIC8BQ9NVN3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RIC8BQ9NVN3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIC8BQ9NVN3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIC8BQ9NVN3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RIC8BQ9NVN3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RIC8BQ9NVN3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIC8BQ9NVN3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIC8BQ9NVN3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIC8BQ9NVN3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIC8BQ9NVN3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIC8BQ9NVN3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIC8BQ9NVN3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RIC8BQ9NVN3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RIC8BQ9NVN3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RIC8BQ9NVN3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RIC8BQ9NVN3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RIC8BQ9NVN3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RIC8BQ9NVN3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RIC8BQ9NVN3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RIC8BQ9NVN3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RIC8BQ9NVN3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RIC8BQ9NVN3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RIC8BQ9NVN3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RIC8BQ9NVN3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RIC8BQ9NVN3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RIC8BQ9NVN3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RIC8BQ9NVN3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIC8BQ9NVN3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIC8BQ9NVN3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIC8BQ9NVN3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIC8BQ9NVN3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIC8BQ9NVN3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIC8BQ9NVN3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RIC8BQ9NVN3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIC8BQ9NVN3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIC8BQ9NVN3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIC8BQ9NVN3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIC8BQ9NVN3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIC8BQ9NVN3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIC8BQ9NVN3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIC8BQ9NVN3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RIC8BQ9NVN3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIC8BQ9NVN3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIC8BQ9NVN3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIC8BQ9NVN3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIC8BQ9NVN3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIC8BQ9NVN3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIC8BQ9NVN3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIC8BQ9NVN3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIC8BQ9NVN3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIC8BQ9NVN3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIC8BQ9NVN3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIC8BQ9NVN3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIC8BQ9NVN3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIC8BQ9NVN3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIC8BQ9NVN3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIC8BQ9NVN3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RIC8BQ9NVN3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIC8BQ9NVN3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIC8BQ9NVN3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIC8BQ9NVN3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIC8BQ9NVN3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIC8BQ9NVN3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIC8BQ9NVN3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIC8BQ9NVN3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIC8BQ9NVN3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIC8BQ9NVN3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIC8BQ9NVN3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RIC8BQ9NVN3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIC8BQ9NVN3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIC8BQ9NVN3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIC8BQ9NVN3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIC8BQ9NVN3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIC8BQ9NVN3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIC8BQ9NVN3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIC8BQ9NVN3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIC8BQ9NVN3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIC8BQ9NVN3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RIC8BQ9NVN3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIC8BQ9NVN3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIC8BQ9NVN3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIC8BQ9NVN3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIC8BQ9NVN3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIC8BQ9NVN3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIC8BQ9NVN3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms