Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.78■■■■□ 3
DUOX1Q9NRD9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
DUOX1Q9NRD9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
DUOX1Q9NRD9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
DUOX1Q9NRD9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
DUOX1Q9NRD9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
DUOX1Q9NRD9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
DUOX1Q9NRD9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
DUOX1Q9NRD9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
DUOX1Q9NRD9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DUOX1Q9NRD9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
DUOX1Q9NRD9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
DUOX1Q9NRD9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DUOX1Q9NRD9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DUOX1Q9NRD9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
DUOX1Q9NRD9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
DUOX1Q9NRD9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
DUOX1Q9NRD9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
DUOX1Q9NRD9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
DUOX1Q9NRD9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
DUOX1Q9NRD9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
DUOX1Q9NRD9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
DUOX1Q9NRD9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
DUOX1Q9NRD9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
DUOX1Q9NRD9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
DUOX1Q9NRD9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
DUOX1Q9NRD9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
DUOX1Q9NRD9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
DUOX1Q9NRD9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
DUOX1Q9NRD9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DUOX1Q9NRD9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DUOX1Q9NRD9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DUOX1Q9NRD9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DUOX1Q9NRD9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
DUOX1Q9NRD9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
DUOX1Q9NRD9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DUOX1Q9NRD9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
DUOX1Q9NRD9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
DUOX1Q9NRD9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
DUOX1Q9NRD9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
DUOX1Q9NRD9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DUOX1Q9NRD9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DUOX1Q9NRD9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DUOX1Q9NRD9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
DUOX1Q9NRD9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DUOX1Q9NRD9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DUOX1Q9NRD9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
DUOX1Q9NRD9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
DUOX1Q9NRD9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
DUOX1Q9NRD9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
DUOX1Q9NRD9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
DUOX1Q9NRD9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
DUOX1Q9NRD9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DUOX1Q9NRD9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
DUOX1Q9NRD9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DUOX1Q9NRD9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DUOX1Q9NRD9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DUOX1Q9NRD9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DUOX1Q9NRD9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
DUOX1Q9NRD9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
DUOX1Q9NRD9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
DUOX1Q9NRD9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
DUOX1Q9NRD9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
DUOX1Q9NRD9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DUOX1Q9NRD9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
DUOX1Q9NRD9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DUOX1Q9NRD9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DUOX1Q9NRD9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DUOX1Q9NRD9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
DUOX1Q9NRD9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DUOX1Q9NRD9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
DUOX1Q9NRD9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DUOX1Q9NRD9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DUOX1Q9NRD9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DUOX1Q9NRD9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DUOX1Q9NRD9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DUOX1Q9NRD9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DUOX1Q9NRD9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
DUOX1Q9NRD9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
DUOX1Q9NRD9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
DUOX1Q9NRD9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
DUOX1Q9NRD9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DUOX1Q9NRD9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
DUOX1Q9NRD9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
DUOX1Q9NRD9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
DUOX1Q9NRD9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DUOX1Q9NRD9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DUOX1Q9NRD9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
DUOX1Q9NRD9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DUOX1Q9NRD9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DUOX1Q9NRD9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DUOX1Q9NRD9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DUOX1Q9NRD9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
DUOX1Q9NRD9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
DUOX1Q9NRD9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
DUOX1Q9NRD9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
DUOX1Q9NRD9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
DUOX1Q9NRD9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
DUOX1Q9NRD9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
DUOX1Q9NRD9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms