Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNK9Q9NPC2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNK9Q9NPC2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNK9Q9NPC2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNK9Q9NPC2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNK9Q9NPC2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNK9Q9NPC2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNK9Q9NPC2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNK9Q9NPC2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNK9Q9NPC2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNK9Q9NPC2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNK9Q9NPC2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNK9Q9NPC2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNK9Q9NPC2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNK9Q9NPC2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNK9Q9NPC2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNK9Q9NPC2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNK9Q9NPC2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNK9Q9NPC2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNK9Q9NPC2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNK9Q9NPC2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNK9Q9NPC2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNK9Q9NPC2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNK9Q9NPC2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNK9Q9NPC2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNK9Q9NPC2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNK9Q9NPC2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNK9Q9NPC2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNK9Q9NPC2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNK9Q9NPC2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNK9Q9NPC2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNK9Q9NPC2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNK9Q9NPC2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNK9Q9NPC2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNK9Q9NPC2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNK9Q9NPC2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNK9Q9NPC2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNK9Q9NPC2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNK9Q9NPC2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNK9Q9NPC2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNK9Q9NPC2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNK9Q9NPC2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KCNK9Q9NPC2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KCNK9Q9NPC2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNK9Q9NPC2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNK9Q9NPC2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNK9Q9NPC2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNK9Q9NPC2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNK9Q9NPC2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNK9Q9NPC2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNK9Q9NPC2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNK9Q9NPC2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNK9Q9NPC2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNK9Q9NPC2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNK9Q9NPC2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNK9Q9NPC2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNK9Q9NPC2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNK9Q9NPC2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNK9Q9NPC2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNK9Q9NPC2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
KCNK9Q9NPC2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNK9Q9NPC2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNK9Q9NPC2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNK9Q9NPC2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNK9Q9NPC2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNK9Q9NPC2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNK9Q9NPC2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNK9Q9NPC2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNK9Q9NPC2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNK9Q9NPC2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNK9Q9NPC2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNK9Q9NPC2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNK9Q9NPC2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNK9Q9NPC2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNK9Q9NPC2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNK9Q9NPC2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNK9Q9NPC2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNK9Q9NPC2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNK9Q9NPC2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNK9Q9NPC2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNK9Q9NPC2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNK9Q9NPC2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNK9Q9NPC2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNK9Q9NPC2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNK9Q9NPC2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNK9Q9NPC2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNK9Q9NPC2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNK9Q9NPC2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNK9Q9NPC2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KCNK9Q9NPC2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KCNK9Q9NPC2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNK9Q9NPC2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNK9Q9NPC2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNK9Q9NPC2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNK9Q9NPC2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNK9Q9NPC2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNK9Q9NPC2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNK9Q9NPC2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNK9Q9NPC2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNK9Q9NPC2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms