Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLXNA4Q9HCM2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLXNA4Q9HCM2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLXNA4Q9HCM2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLXNA4Q9HCM2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLXNA4Q9HCM2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLXNA4Q9HCM2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLXNA4Q9HCM2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLXNA4Q9HCM2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLXNA4Q9HCM2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLXNA4Q9HCM2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PLXNA4Q9HCM2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLXNA4Q9HCM2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLXNA4Q9HCM2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLXNA4Q9HCM2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLXNA4Q9HCM2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNA4Q9HCM2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNA4Q9HCM2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNA4Q9HCM2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNA4Q9HCM2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNA4Q9HCM2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNA4Q9HCM2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNA4Q9HCM2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNA4Q9HCM2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLXNA4Q9HCM2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLXNA4Q9HCM2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNA4Q9HCM2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNA4Q9HCM2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLXNA4Q9HCM2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLXNA4Q9HCM2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLXNA4Q9HCM2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLXNA4Q9HCM2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLXNA4Q9HCM2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLXNA4Q9HCM2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PLXNA4Q9HCM2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLXNA4Q9HCM2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLXNA4Q9HCM2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLXNA4Q9HCM2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNA4Q9HCM2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLXNA4Q9HCM2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PLXNA4Q9HCM2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLXNA4Q9HCM2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNA4Q9HCM2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNA4Q9HCM2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNA4Q9HCM2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNA4Q9HCM2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLXNA4Q9HCM2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLXNA4Q9HCM2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLXNA4Q9HCM2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLXNA4Q9HCM2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLXNA4Q9HCM2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLXNA4Q9HCM2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLXNA4Q9HCM2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLXNA4Q9HCM2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLXNA4Q9HCM2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PLXNA4Q9HCM2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLXNA4Q9HCM2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLXNA4Q9HCM2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLXNA4Q9HCM2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLXNA4Q9HCM2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNA4Q9HCM2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNA4Q9HCM2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLXNA4Q9HCM2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNA4Q9HCM2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNA4Q9HCM2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNA4Q9HCM2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNA4Q9HCM2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLXNA4Q9HCM2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLXNA4Q9HCM2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLXNA4Q9HCM2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLXNA4Q9HCM2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLXNA4Q9HCM2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNA4Q9HCM2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNA4Q9HCM2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNA4Q9HCM2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNA4Q9HCM2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNA4Q9HCM2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNA4Q9HCM2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLXNA4Q9HCM2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNA4Q9HCM2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNA4Q9HCM2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNA4Q9HCM2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNA4Q9HCM2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLXNA4Q9HCM2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLXNA4Q9HCM2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PLXNA4Q9HCM2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PLXNA4Q9HCM2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNA4Q9HCM2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNA4Q9HCM2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNA4Q9HCM2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNA4Q9HCM2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNA4Q9HCM2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNA4Q9HCM2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNA4Q9HCM2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNA4Q9HCM2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNA4Q9HCM2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNA4Q9HCM2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNA4Q9HCM2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms