Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ELL3Q9HB65 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELL3Q9HB65 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELL3Q9HB65 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELL3Q9HB65 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELL3Q9HB65 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELL3Q9HB65 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELL3Q9HB65 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL3Q9HB65 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL3Q9HB65 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL3Q9HB65 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL3Q9HB65 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL3Q9HB65 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL3Q9HB65 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL3Q9HB65 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL3Q9HB65 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL3Q9HB65 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL3Q9HB65 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL3Q9HB65 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL3Q9HB65 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELL3Q9HB65 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELL3Q9HB65 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELL3Q9HB65 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELL3Q9HB65 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELL3Q9HB65 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ELL3Q9HB65 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ELL3Q9HB65 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ELL3Q9HB65 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ELL3Q9HB65 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELL3Q9HB65 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELL3Q9HB65 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELL3Q9HB65 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELL3Q9HB65 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELL3Q9HB65 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ELL3Q9HB65 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELL3Q9HB65 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELL3Q9HB65 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELL3Q9HB65 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELL3Q9HB65 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELL3Q9HB65 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELL3Q9HB65 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELL3Q9HB65 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELL3Q9HB65 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELL3Q9HB65 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELL3Q9HB65 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELL3Q9HB65 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELL3Q9HB65 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ELL3Q9HB65 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELL3Q9HB65 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELL3Q9HB65 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELL3Q9HB65 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELL3Q9HB65 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELL3Q9HB65 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELL3Q9HB65 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELL3Q9HB65 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELL3Q9HB65 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELL3Q9HB65 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELL3Q9HB65 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL3Q9HB65 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL3Q9HB65 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL3Q9HB65 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELL3Q9HB65 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL3Q9HB65 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL3Q9HB65 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELL3Q9HB65 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL3Q9HB65 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL3Q9HB65 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELL3Q9HB65 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ELL3Q9HB65 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ELL3Q9HB65 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ELL3Q9HB65 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ELL3Q9HB65 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ELL3Q9HB65 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ELL3Q9HB65 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ELL3Q9HB65 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ELL3Q9HB65 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELL3Q9HB65 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELL3Q9HB65 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELL3Q9HB65 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms