Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SUDS3Q9H7L9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUDS3Q9H7L9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUDS3Q9H7L9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUDS3Q9H7L9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUDS3Q9H7L9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUDS3Q9H7L9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUDS3Q9H7L9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUDS3Q9H7L9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SUDS3Q9H7L9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SUDS3Q9H7L9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SUDS3Q9H7L9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUDS3Q9H7L9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUDS3Q9H7L9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUDS3Q9H7L9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUDS3Q9H7L9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUDS3Q9H7L9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUDS3Q9H7L9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUDS3Q9H7L9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUDS3Q9H7L9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUDS3Q9H7L9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUDS3Q9H7L9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUDS3Q9H7L9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUDS3Q9H7L9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUDS3Q9H7L9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUDS3Q9H7L9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUDS3Q9H7L9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUDS3Q9H7L9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUDS3Q9H7L9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUDS3Q9H7L9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUDS3Q9H7L9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUDS3Q9H7L9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUDS3Q9H7L9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUDS3Q9H7L9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUDS3Q9H7L9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUDS3Q9H7L9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUDS3Q9H7L9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUDS3Q9H7L9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SUDS3Q9H7L9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUDS3Q9H7L9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUDS3Q9H7L9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUDS3Q9H7L9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SUDS3Q9H7L9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUDS3Q9H7L9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUDS3Q9H7L9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUDS3Q9H7L9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUDS3Q9H7L9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SUDS3Q9H7L9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUDS3Q9H7L9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SUDS3Q9H7L9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUDS3Q9H7L9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUDS3Q9H7L9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUDS3Q9H7L9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUDS3Q9H7L9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUDS3Q9H7L9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUDS3Q9H7L9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUDS3Q9H7L9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUDS3Q9H7L9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUDS3Q9H7L9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUDS3Q9H7L9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUDS3Q9H7L9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUDS3Q9H7L9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUDS3Q9H7L9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SUDS3Q9H7L9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUDS3Q9H7L9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUDS3Q9H7L9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUDS3Q9H7L9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUDS3Q9H7L9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUDS3Q9H7L9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUDS3Q9H7L9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUDS3Q9H7L9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUDS3Q9H7L9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SUDS3Q9H7L9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUDS3Q9H7L9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUDS3Q9H7L9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUDS3Q9H7L9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SUDS3Q9H7L9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SUDS3Q9H7L9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SUDS3Q9H7L9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SUDS3Q9H7L9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUDS3Q9H7L9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUDS3Q9H7L9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SUDS3Q9H7L9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUDS3Q9H7L9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUDS3Q9H7L9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SUDS3Q9H7L9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SUDS3Q9H7L9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SUDS3Q9H7L9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SUDS3Q9H7L9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SUDS3Q9H7L9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUDS3Q9H7L9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUDS3Q9H7L9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUDS3Q9H7L9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUDS3Q9H7L9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SUDS3Q9H7L9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SUDS3Q9H7L9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SUDS3Q9H7L9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SUDS3Q9H7L9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SUDS3Q9H7L9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUDS3Q9H7L9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms