Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C20orf27Q9GZN8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C20orf27Q9GZN8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C20orf27Q9GZN8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C20orf27Q9GZN8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C20orf27Q9GZN8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C20orf27Q9GZN8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C20orf27Q9GZN8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C20orf27Q9GZN8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C20orf27Q9GZN8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C20orf27Q9GZN8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C20orf27Q9GZN8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C20orf27Q9GZN8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C20orf27Q9GZN8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C20orf27Q9GZN8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C20orf27Q9GZN8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C20orf27Q9GZN8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C20orf27Q9GZN8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C20orf27Q9GZN8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
C20orf27Q9GZN8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C20orf27Q9GZN8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C20orf27Q9GZN8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C20orf27Q9GZN8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C20orf27Q9GZN8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C20orf27Q9GZN8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C20orf27Q9GZN8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C20orf27Q9GZN8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C20orf27Q9GZN8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C20orf27Q9GZN8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C20orf27Q9GZN8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C20orf27Q9GZN8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C20orf27Q9GZN8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C20orf27Q9GZN8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C20orf27Q9GZN8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C20orf27Q9GZN8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C20orf27Q9GZN8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
C20orf27Q9GZN8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C20orf27Q9GZN8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
C20orf27Q9GZN8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C20orf27Q9GZN8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C20orf27Q9GZN8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C20orf27Q9GZN8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C20orf27Q9GZN8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C20orf27Q9GZN8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C20orf27Q9GZN8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C20orf27Q9GZN8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C20orf27Q9GZN8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C20orf27Q9GZN8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C20orf27Q9GZN8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C20orf27Q9GZN8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C20orf27Q9GZN8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C20orf27Q9GZN8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C20orf27Q9GZN8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C20orf27Q9GZN8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C20orf27Q9GZN8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
C20orf27Q9GZN8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C20orf27Q9GZN8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C20orf27Q9GZN8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C20orf27Q9GZN8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C20orf27Q9GZN8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C20orf27Q9GZN8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C20orf27Q9GZN8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C20orf27Q9GZN8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C20orf27Q9GZN8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C20orf27Q9GZN8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C20orf27Q9GZN8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C20orf27Q9GZN8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C20orf27Q9GZN8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C20orf27Q9GZN8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C20orf27Q9GZN8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C20orf27Q9GZN8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C20orf27Q9GZN8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C20orf27Q9GZN8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C20orf27Q9GZN8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C20orf27Q9GZN8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C20orf27Q9GZN8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
C20orf27Q9GZN8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C20orf27Q9GZN8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C20orf27Q9GZN8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C20orf27Q9GZN8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C20orf27Q9GZN8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C20orf27Q9GZN8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C20orf27Q9GZN8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C20orf27Q9GZN8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C20orf27Q9GZN8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
C20orf27Q9GZN8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C20orf27Q9GZN8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
C20orf27Q9GZN8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C20orf27Q9GZN8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C20orf27Q9GZN8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C20orf27Q9GZN8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C20orf27Q9GZN8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C20orf27Q9GZN8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C20orf27Q9GZN8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C20orf27Q9GZN8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C20orf27Q9GZN8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C20orf27Q9GZN8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C20orf27Q9GZN8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C20orf27Q9GZN8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C20orf27Q9GZN8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
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