Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN1

ACTR6, Actin-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR6Q9GZN1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTR6Q9GZN1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTR6Q9GZN1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTR6Q9GZN1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTR6Q9GZN1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTR6Q9GZN1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTR6Q9GZN1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTR6Q9GZN1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTR6Q9GZN1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTR6Q9GZN1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTR6Q9GZN1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTR6Q9GZN1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTR6Q9GZN1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTR6Q9GZN1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTR6Q9GZN1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTR6Q9GZN1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTR6Q9GZN1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTR6Q9GZN1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTR6Q9GZN1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTR6Q9GZN1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTR6Q9GZN1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTR6Q9GZN1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACTR6Q9GZN1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTR6Q9GZN1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTR6Q9GZN1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTR6Q9GZN1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTR6Q9GZN1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTR6Q9GZN1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTR6Q9GZN1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTR6Q9GZN1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR6Q9GZN1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR6Q9GZN1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR6Q9GZN1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR6Q9GZN1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR6Q9GZN1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTR6Q9GZN1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR6Q9GZN1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR6Q9GZN1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR6Q9GZN1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR6Q9GZN1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR6Q9GZN1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTR6Q9GZN1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTR6Q9GZN1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTR6Q9GZN1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTR6Q9GZN1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTR6Q9GZN1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTR6Q9GZN1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTR6Q9GZN1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTR6Q9GZN1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTR6Q9GZN1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTR6Q9GZN1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTR6Q9GZN1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTR6Q9GZN1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTR6Q9GZN1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTR6Q9GZN1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTR6Q9GZN1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTR6Q9GZN1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTR6Q9GZN1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTR6Q9GZN1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTR6Q9GZN1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTR6Q9GZN1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTR6Q9GZN1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTR6Q9GZN1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTR6Q9GZN1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTR6Q9GZN1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTR6Q9GZN1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTR6Q9GZN1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTR6Q9GZN1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTR6Q9GZN1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTR6Q9GZN1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTR6Q9GZN1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTR6Q9GZN1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTR6Q9GZN1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTR6Q9GZN1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTR6Q9GZN1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTR6Q9GZN1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTR6Q9GZN1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTR6Q9GZN1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTR6Q9GZN1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTR6Q9GZN1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTR6Q9GZN1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTR6Q9GZN1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTR6Q9GZN1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTR6Q9GZN1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR6Q9GZN1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR6Q9GZN1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTR6Q9GZN1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTR6Q9GZN1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTR6Q9GZN1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTR6Q9GZN1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTR6Q9GZN1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTR6Q9GZN1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTR6Q9GZN1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTR6Q9GZN1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTR6Q9GZN1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTR6Q9GZN1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTR6Q9GZN1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR6Q9GZN1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR6Q9GZN1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTR6Q9GZN1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms