Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SELENOOQ9BVL4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SELENOOQ9BVL4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SELENOOQ9BVL4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SELENOOQ9BVL4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SELENOOQ9BVL4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SELENOOQ9BVL4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SELENOOQ9BVL4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SELENOOQ9BVL4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SELENOOQ9BVL4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SELENOOQ9BVL4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SELENOOQ9BVL4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SELENOOQ9BVL4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SELENOOQ9BVL4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SELENOOQ9BVL4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SELENOOQ9BVL4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SELENOOQ9BVL4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SELENOOQ9BVL4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SELENOOQ9BVL4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SELENOOQ9BVL4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SELENOOQ9BVL4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SELENOOQ9BVL4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SELENOOQ9BVL4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SELENOOQ9BVL4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SELENOOQ9BVL4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SELENOOQ9BVL4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SELENOOQ9BVL4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SELENOOQ9BVL4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SELENOOQ9BVL4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SELENOOQ9BVL4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SELENOOQ9BVL4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SELENOOQ9BVL4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SELENOOQ9BVL4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SELENOOQ9BVL4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SELENOOQ9BVL4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SELENOOQ9BVL4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SELENOOQ9BVL4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SELENOOQ9BVL4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SELENOOQ9BVL4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SELENOOQ9BVL4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SELENOOQ9BVL4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SELENOOQ9BVL4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SELENOOQ9BVL4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SELENOOQ9BVL4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SELENOOQ9BVL4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SELENOOQ9BVL4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SELENOOQ9BVL4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SELENOOQ9BVL4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SELENOOQ9BVL4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SELENOOQ9BVL4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SELENOOQ9BVL4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SELENOOQ9BVL4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SELENOOQ9BVL4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SELENOOQ9BVL4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SELENOOQ9BVL4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SELENOOQ9BVL4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SELENOOQ9BVL4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SELENOOQ9BVL4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SELENOOQ9BVL4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SELENOOQ9BVL4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SELENOOQ9BVL4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SELENOOQ9BVL4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SELENOOQ9BVL4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SELENOOQ9BVL4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SELENOOQ9BVL4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SELENOOQ9BVL4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SELENOOQ9BVL4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SELENOOQ9BVL4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SELENOOQ9BVL4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SELENOOQ9BVL4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SELENOOQ9BVL4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SELENOOQ9BVL4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SELENOOQ9BVL4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SELENOOQ9BVL4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SELENOOQ9BVL4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SELENOOQ9BVL4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SELENOOQ9BVL4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SELENOOQ9BVL4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SELENOOQ9BVL4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SELENOOQ9BVL4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SELENOOQ9BVL4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SELENOOQ9BVL4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SELENOOQ9BVL4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SELENOOQ9BVL4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SELENOOQ9BVL4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SELENOOQ9BVL4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SELENOOQ9BVL4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SELENOOQ9BVL4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SELENOOQ9BVL4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SELENOOQ9BVL4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SELENOOQ9BVL4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SELENOOQ9BVL4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SELENOOQ9BVL4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SELENOOQ9BVL4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SELENOOQ9BVL4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SELENOOQ9BVL4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SELENOOQ9BVL4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SELENOOQ9BVL4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SELENOOQ9BVL4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SELENOOQ9BVL4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.9 ms