Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBB6Q9BUF5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBB6Q9BUF5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBB6Q9BUF5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBB6Q9BUF5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBB6Q9BUF5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBB6Q9BUF5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBB6Q9BUF5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBB6Q9BUF5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBB6Q9BUF5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBB6Q9BUF5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TUBB6Q9BUF5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB6Q9BUF5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBB6Q9BUF5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBB6Q9BUF5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBB6Q9BUF5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB6Q9BUF5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBB6Q9BUF5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBB6Q9BUF5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBB6Q9BUF5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBB6Q9BUF5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBB6Q9BUF5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBB6Q9BUF5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBB6Q9BUF5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBB6Q9BUF5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBB6Q9BUF5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBB6Q9BUF5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB6Q9BUF5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB6Q9BUF5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB6Q9BUF5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBB6Q9BUF5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBB6Q9BUF5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBB6Q9BUF5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBB6Q9BUF5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB6Q9BUF5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB6Q9BUF5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBB6Q9BUF5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB6Q9BUF5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB6Q9BUF5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB6Q9BUF5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB6Q9BUF5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB6Q9BUF5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB6Q9BUF5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB6Q9BUF5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBB6Q9BUF5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBB6Q9BUF5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBB6Q9BUF5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB6Q9BUF5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB6Q9BUF5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB6Q9BUF5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB6Q9BUF5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB6Q9BUF5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB6Q9BUF5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB6Q9BUF5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB6Q9BUF5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB6Q9BUF5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB6Q9BUF5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB6Q9BUF5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB6Q9BUF5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB6Q9BUF5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB6Q9BUF5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB6Q9BUF5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB6Q9BUF5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB6Q9BUF5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBB6Q9BUF5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBB6Q9BUF5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBB6Q9BUF5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB6Q9BUF5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBB6Q9BUF5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBB6Q9BUF5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBB6Q9BUF5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBB6Q9BUF5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBB6Q9BUF5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBB6Q9BUF5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBB6Q9BUF5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBB6Q9BUF5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBB6Q9BUF5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBB6Q9BUF5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB6Q9BUF5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB6Q9BUF5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB6Q9BUF5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB6Q9BUF5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBB6Q9BUF5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBB6Q9BUF5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBB6Q9BUF5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBB6Q9BUF5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBB6Q9BUF5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBB6Q9BUF5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBB6Q9BUF5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBB6Q9BUF5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBB6Q9BUF5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBB6Q9BUF5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBB6Q9BUF5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TUBB6Q9BUF5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TUBB6Q9BUF5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBB6Q9BUF5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB6Q9BUF5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB6Q9BUF5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBB6Q9BUF5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBB6Q9BUF5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms