Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFI1Q99684 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFI1Q99684 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFI1Q99684 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GFI1Q99684 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GFI1Q99684 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFI1Q99684 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFI1Q99684 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GFI1Q99684 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GFI1Q99684 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GFI1Q99684 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFI1Q99684 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFI1Q99684 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFI1Q99684 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFI1Q99684 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFI1Q99684 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFI1Q99684 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFI1Q99684 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFI1Q99684 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFI1Q99684 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFI1Q99684 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFI1Q99684 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFI1Q99684 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFI1Q99684 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GFI1Q99684 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GFI1Q99684 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFI1Q99684 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFI1Q99684 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFI1Q99684 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFI1Q99684 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GFI1Q99684 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFI1Q99684 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GFI1Q99684 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GFI1Q99684 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFI1Q99684 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFI1Q99684 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFI1Q99684 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFI1Q99684 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFI1Q99684 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFI1Q99684 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFI1Q99684 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFI1Q99684 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFI1Q99684 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFI1Q99684 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFI1Q99684 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFI1Q99684 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFI1Q99684 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GFI1Q99684 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GFI1Q99684 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GFI1Q99684 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GFI1Q99684 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GFI1Q99684 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GFI1Q99684 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFI1Q99684 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFI1Q99684 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFI1Q99684 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFI1Q99684 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFI1Q99684 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFI1Q99684 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GFI1Q99684 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GFI1Q99684 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GFI1Q99684 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GFI1Q99684 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GFI1Q99684 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFI1Q99684 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFI1Q99684 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFI1Q99684 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFI1Q99684 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFI1Q99684 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFI1Q99684 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFI1Q99684 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFI1Q99684 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFI1Q99684 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFI1Q99684 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFI1Q99684 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFI1Q99684 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFI1Q99684 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFI1Q99684 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFI1Q99684 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFI1Q99684 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFI1Q99684 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms