Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT0

Putative uncharacterized protein FLJ31958, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MT0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q96MT0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q96MT0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q96MT0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q96MT0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q96MT0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q96MT0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q96MT0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q96MT0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q96MT0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q96MT0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q96MT0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q96MT0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q96MT0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q96MT0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q96MT0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q96MT0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q96MT0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q96MT0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q96MT0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q96MT0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q96MT0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q96MT0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Q96MT0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q96MT0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q96MT0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q96MT0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q96MT0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q96MT0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q96MT0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q96MT0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q96MT0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q96MT0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q96MT0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q96MT0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q96MT0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q96MT0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q96MT0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q96MT0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q96MT0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q96MT0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q96MT0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q96MT0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q96MT0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q96MT0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q96MT0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q96MT0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q96MT0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q96MT0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q96MT0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q96MT0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q96MT0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q96MT0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q96MT0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q96MT0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q96MT0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q96MT0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q96MT0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Q96MT0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q96MT0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q96MT0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q96MT0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q96MT0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q96MT0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q96MT0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q96MT0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q96MT0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q96MT0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q96MT0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q96MT0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q96MT0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q96MT0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q96MT0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q96MT0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q96MT0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q96MT0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q96MT0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q96MT0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q96MT0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q96MT0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q96MT0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q96MT0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q96MT0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q96MT0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q96MT0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q96MT0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q96MT0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q96MT0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q96MT0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q96MT0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q96MT0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q96MT0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q96MT0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q96MT0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q96MT0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q96MT0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q96MT0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q96MT0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q96MT0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q96MT0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms