Protein–RNA interactions for Protein: Q96MM7

HS6ST2, Heparan-sulfate 6-O-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS6ST2Q96MM7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HS6ST2Q96MM7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HS6ST2Q96MM7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HS6ST2Q96MM7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HS6ST2Q96MM7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HS6ST2Q96MM7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HS6ST2Q96MM7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HS6ST2Q96MM7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HS6ST2Q96MM7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HS6ST2Q96MM7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HS6ST2Q96MM7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HS6ST2Q96MM7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HS6ST2Q96MM7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HS6ST2Q96MM7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HS6ST2Q96MM7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HS6ST2Q96MM7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HS6ST2Q96MM7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HS6ST2Q96MM7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HS6ST2Q96MM7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HS6ST2Q96MM7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HS6ST2Q96MM7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HS6ST2Q96MM7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HS6ST2Q96MM7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HS6ST2Q96MM7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HS6ST2Q96MM7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HS6ST2Q96MM7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HS6ST2Q96MM7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HS6ST2Q96MM7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HS6ST2Q96MM7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HS6ST2Q96MM7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HS6ST2Q96MM7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HS6ST2Q96MM7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HS6ST2Q96MM7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HS6ST2Q96MM7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HS6ST2Q96MM7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HS6ST2Q96MM7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HS6ST2Q96MM7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HS6ST2Q96MM7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HS6ST2Q96MM7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS6ST2Q96MM7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS6ST2Q96MM7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HS6ST2Q96MM7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HS6ST2Q96MM7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HS6ST2Q96MM7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HS6ST2Q96MM7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HS6ST2Q96MM7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HS6ST2Q96MM7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HS6ST2Q96MM7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HS6ST2Q96MM7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HS6ST2Q96MM7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HS6ST2Q96MM7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS6ST2Q96MM7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS6ST2Q96MM7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS6ST2Q96MM7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS6ST2Q96MM7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS6ST2Q96MM7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HS6ST2Q96MM7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS6ST2Q96MM7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS6ST2Q96MM7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HS6ST2Q96MM7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS6ST2Q96MM7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS6ST2Q96MM7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS6ST2Q96MM7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS6ST2Q96MM7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS6ST2Q96MM7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS6ST2Q96MM7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS6ST2Q96MM7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS6ST2Q96MM7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HS6ST2Q96MM7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HS6ST2Q96MM7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HS6ST2Q96MM7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HS6ST2Q96MM7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS6ST2Q96MM7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS6ST2Q96MM7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS6ST2Q96MM7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS6ST2Q96MM7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HS6ST2Q96MM7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HS6ST2Q96MM7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms