Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGSM3Q96HU1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGSM3Q96HU1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGSM3Q96HU1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGSM3Q96HU1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGSM3Q96HU1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SGSM3Q96HU1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGSM3Q96HU1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGSM3Q96HU1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGSM3Q96HU1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGSM3Q96HU1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGSM3Q96HU1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGSM3Q96HU1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGSM3Q96HU1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGSM3Q96HU1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGSM3Q96HU1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGSM3Q96HU1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGSM3Q96HU1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGSM3Q96HU1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGSM3Q96HU1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SGSM3Q96HU1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SGSM3Q96HU1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SGSM3Q96HU1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SGSM3Q96HU1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SGSM3Q96HU1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SGSM3Q96HU1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SGSM3Q96HU1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGSM3Q96HU1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGSM3Q96HU1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGSM3Q96HU1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGSM3Q96HU1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGSM3Q96HU1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGSM3Q96HU1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGSM3Q96HU1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGSM3Q96HU1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGSM3Q96HU1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGSM3Q96HU1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGSM3Q96HU1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGSM3Q96HU1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGSM3Q96HU1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SGSM3Q96HU1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGSM3Q96HU1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGSM3Q96HU1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGSM3Q96HU1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGSM3Q96HU1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGSM3Q96HU1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SGSM3Q96HU1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SGSM3Q96HU1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGSM3Q96HU1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGSM3Q96HU1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SGSM3Q96HU1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGSM3Q96HU1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGSM3Q96HU1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGSM3Q96HU1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SGSM3Q96HU1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SGSM3Q96HU1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SGSM3Q96HU1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SGSM3Q96HU1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGSM3Q96HU1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGSM3Q96HU1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SGSM3Q96HU1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGSM3Q96HU1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGSM3Q96HU1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGSM3Q96HU1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGSM3Q96HU1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGSM3Q96HU1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGSM3Q96HU1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGSM3Q96HU1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGSM3Q96HU1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SGSM3Q96HU1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGSM3Q96HU1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGSM3Q96HU1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGSM3Q96HU1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGSM3Q96HU1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGSM3Q96HU1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGSM3Q96HU1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGSM3Q96HU1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGSM3Q96HU1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGSM3Q96HU1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SGSM3Q96HU1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SGSM3Q96HU1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SGSM3Q96HU1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms