Protein–RNA interactions for Protein: Q96D42

HAVCR1, Hepatitis A virus cellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR1Q96D42 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HAVCR1Q96D42 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HAVCR1Q96D42 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HAVCR1Q96D42 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HAVCR1Q96D42 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HAVCR1Q96D42 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HAVCR1Q96D42 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HAVCR1Q96D42 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HAVCR1Q96D42 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HAVCR1Q96D42 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HAVCR1Q96D42 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HAVCR1Q96D42 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HAVCR1Q96D42 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HAVCR1Q96D42 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HAVCR1Q96D42 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HAVCR1Q96D42 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HAVCR1Q96D42 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HAVCR1Q96D42 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HAVCR1Q96D42 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HAVCR1Q96D42 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HAVCR1Q96D42 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HAVCR1Q96D42 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HAVCR1Q96D42 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HAVCR1Q96D42 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HAVCR1Q96D42 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HAVCR1Q96D42 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HAVCR1Q96D42 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HAVCR1Q96D42 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HAVCR1Q96D42 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HAVCR1Q96D42 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HAVCR1Q96D42 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HAVCR1Q96D42 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HAVCR1Q96D42 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HAVCR1Q96D42 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HAVCR1Q96D42 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HAVCR1Q96D42 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HAVCR1Q96D42 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HAVCR1Q96D42 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HAVCR1Q96D42 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HAVCR1Q96D42 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HAVCR1Q96D42 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HAVCR1Q96D42 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HAVCR1Q96D42 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HAVCR1Q96D42 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HAVCR1Q96D42 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HAVCR1Q96D42 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HAVCR1Q96D42 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HAVCR1Q96D42 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HAVCR1Q96D42 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HAVCR1Q96D42 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HAVCR1Q96D42 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HAVCR1Q96D42 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HAVCR1Q96D42 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HAVCR1Q96D42 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HAVCR1Q96D42 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HAVCR1Q96D42 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HAVCR1Q96D42 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HAVCR1Q96D42 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HAVCR1Q96D42 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HAVCR1Q96D42 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HAVCR1Q96D42 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HAVCR1Q96D42 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HAVCR1Q96D42 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HAVCR1Q96D42 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HAVCR1Q96D42 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HAVCR1Q96D42 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HAVCR1Q96D42 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HAVCR1Q96D42 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HAVCR1Q96D42 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HAVCR1Q96D42 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HAVCR1Q96D42 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HAVCR1Q96D42 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HAVCR1Q96D42 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HAVCR1Q96D42 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HAVCR1Q96D42 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HAVCR1Q96D42 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HAVCR1Q96D42 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HAVCR1Q96D42 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HAVCR1Q96D42 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HAVCR1Q96D42 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HAVCR1Q96D42 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HAVCR1Q96D42 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HAVCR1Q96D42 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HAVCR1Q96D42 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HAVCR1Q96D42 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HAVCR1Q96D42 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HAVCR1Q96D42 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HAVCR1Q96D42 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HAVCR1Q96D42 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HAVCR1Q96D42 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HAVCR1Q96D42 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HAVCR1Q96D42 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HAVCR1Q96D42 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HAVCR1Q96D42 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HAVCR1Q96D42 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HAVCR1Q96D42 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HAVCR1Q96D42 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HAVCR1Q96D42 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HAVCR1Q96D42 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HAVCR1Q96D42 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms