Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDCCAG3Q96C92 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDCCAG3Q96C92 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDCCAG3Q96C92 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDCCAG3Q96C92 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDCCAG3Q96C92 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SDCCAG3Q96C92 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDCCAG3Q96C92 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDCCAG3Q96C92 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDCCAG3Q96C92 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SDCCAG3Q96C92 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDCCAG3Q96C92 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDCCAG3Q96C92 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDCCAG3Q96C92 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDCCAG3Q96C92 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDCCAG3Q96C92 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDCCAG3Q96C92 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDCCAG3Q96C92 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDCCAG3Q96C92 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDCCAG3Q96C92 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDCCAG3Q96C92 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDCCAG3Q96C92 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDCCAG3Q96C92 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDCCAG3Q96C92 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDCCAG3Q96C92 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDCCAG3Q96C92 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SDCCAG3Q96C92 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDCCAG3Q96C92 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDCCAG3Q96C92 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDCCAG3Q96C92 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDCCAG3Q96C92 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDCCAG3Q96C92 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SDCCAG3Q96C92 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDCCAG3Q96C92 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDCCAG3Q96C92 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDCCAG3Q96C92 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDCCAG3Q96C92 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDCCAG3Q96C92 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDCCAG3Q96C92 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDCCAG3Q96C92 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDCCAG3Q96C92 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SDCCAG3Q96C92 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDCCAG3Q96C92 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDCCAG3Q96C92 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDCCAG3Q96C92 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDCCAG3Q96C92 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDCCAG3Q96C92 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDCCAG3Q96C92 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDCCAG3Q96C92 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDCCAG3Q96C92 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDCCAG3Q96C92 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDCCAG3Q96C92 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SDCCAG3Q96C92 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDCCAG3Q96C92 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDCCAG3Q96C92 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDCCAG3Q96C92 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDCCAG3Q96C92 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDCCAG3Q96C92 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SDCCAG3Q96C92 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDCCAG3Q96C92 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDCCAG3Q96C92 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDCCAG3Q96C92 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDCCAG3Q96C92 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDCCAG3Q96C92 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDCCAG3Q96C92 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SDCCAG3Q96C92 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDCCAG3Q96C92 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDCCAG3Q96C92 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDCCAG3Q96C92 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SDCCAG3Q96C92 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SDCCAG3Q96C92 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDCCAG3Q96C92 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDCCAG3Q96C92 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDCCAG3Q96C92 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDCCAG3Q96C92 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDCCAG3Q96C92 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDCCAG3Q96C92 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDCCAG3Q96C92 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms