Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PEX13Q92968 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PEX13Q92968 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PEX13Q92968 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PEX13Q92968 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PEX13Q92968 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PEX13Q92968 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PEX13Q92968 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PEX13Q92968 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PEX13Q92968 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PEX13Q92968 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PEX13Q92968 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PEX13Q92968 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PEX13Q92968 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PEX13Q92968 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PEX13Q92968 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEX13Q92968 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEX13Q92968 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEX13Q92968 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEX13Q92968 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PEX13Q92968 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PEX13Q92968 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PEX13Q92968 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PEX13Q92968 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PEX13Q92968 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PEX13Q92968 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX13Q92968 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PEX13Q92968 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PEX13Q92968 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEX13Q92968 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEX13Q92968 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEX13Q92968 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PEX13Q92968 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PEX13Q92968 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX13Q92968 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX13Q92968 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX13Q92968 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX13Q92968 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX13Q92968 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PEX13Q92968 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PEX13Q92968 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PEX13Q92968 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PEX13Q92968 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PEX13Q92968 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PEX13Q92968 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PEX13Q92968 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PEX13Q92968 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PEX13Q92968 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PEX13Q92968 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PEX13Q92968 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PEX13Q92968 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX13Q92968 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PEX13Q92968 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PEX13Q92968 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PEX13Q92968 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PEX13Q92968 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PEX13Q92968 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PEX13Q92968 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEX13Q92968 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEX13Q92968 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEX13Q92968 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PEX13Q92968 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX13Q92968 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEX13Q92968 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEX13Q92968 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PEX13Q92968 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PEX13Q92968 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PEX13Q92968 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX13Q92968 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX13Q92968 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX13Q92968 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX13Q92968 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PEX13Q92968 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX13Q92968 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX13Q92968 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX13Q92968 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PEX13Q92968 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PEX13Q92968 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PEX13Q92968 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PEX13Q92968 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PEX13Q92968 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PEX13Q92968 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PEX13Q92968 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PEX13Q92968 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PEX13Q92968 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PEX13Q92968 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PEX13Q92968 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PEX13Q92968 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PEX13Q92968 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PEX13Q92968 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PEX13Q92968 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PEX13Q92968 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PEX13Q92968 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PEX13Q92968 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PEX13Q92968 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PEX13Q92968 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PEX13Q92968 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PEX13Q92968 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PEX13Q92968 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PEX13Q92968 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms