Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSC4DQ8WTU2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSC4DQ8WTU2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSC4DQ8WTU2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSC4DQ8WTU2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSC4DQ8WTU2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSC4DQ8WTU2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSC4DQ8WTU2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSC4DQ8WTU2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSC4DQ8WTU2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSC4DQ8WTU2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSC4DQ8WTU2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSC4DQ8WTU2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSC4DQ8WTU2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSC4DQ8WTU2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSC4DQ8WTU2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSC4DQ8WTU2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSC4DQ8WTU2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSC4DQ8WTU2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSC4DQ8WTU2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSC4DQ8WTU2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSC4DQ8WTU2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SSC4DQ8WTU2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSC4DQ8WTU2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSC4DQ8WTU2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSC4DQ8WTU2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSC4DQ8WTU2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSC4DQ8WTU2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSC4DQ8WTU2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSC4DQ8WTU2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSC4DQ8WTU2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSC4DQ8WTU2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSC4DQ8WTU2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSC4DQ8WTU2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSC4DQ8WTU2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSC4DQ8WTU2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSC4DQ8WTU2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSC4DQ8WTU2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSC4DQ8WTU2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSC4DQ8WTU2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSC4DQ8WTU2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSC4DQ8WTU2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSC4DQ8WTU2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SSC4DQ8WTU2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSC4DQ8WTU2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSC4DQ8WTU2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSC4DQ8WTU2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSC4DQ8WTU2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSC4DQ8WTU2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSC4DQ8WTU2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSC4DQ8WTU2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SSC4DQ8WTU2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSC4DQ8WTU2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSC4DQ8WTU2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSC4DQ8WTU2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSC4DQ8WTU2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC4DQ8WTU2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC4DQ8WTU2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC4DQ8WTU2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC4DQ8WTU2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC4DQ8WTU2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC4DQ8WTU2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC4DQ8WTU2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSC4DQ8WTU2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSC4DQ8WTU2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSC4DQ8WTU2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC4DQ8WTU2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSC4DQ8WTU2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSC4DQ8WTU2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSC4DQ8WTU2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSC4DQ8WTU2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSC4DQ8WTU2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSC4DQ8WTU2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSC4DQ8WTU2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSC4DQ8WTU2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSC4DQ8WTU2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSC4DQ8WTU2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSC4DQ8WTU2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSC4DQ8WTU2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSC4DQ8WTU2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSC4DQ8WTU2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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