Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SSC4DQ8WTU2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SSC4DQ8WTU2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SSC4DQ8WTU2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SSC4DQ8WTU2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SSC4DQ8WTU2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SSC4DQ8WTU2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SSC4DQ8WTU2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SSC4DQ8WTU2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SSC4DQ8WTU2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSC4DQ8WTU2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSC4DQ8WTU2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSC4DQ8WTU2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSC4DQ8WTU2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SSC4DQ8WTU2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSC4DQ8WTU2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SSC4DQ8WTU2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SSC4DQ8WTU2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSC4DQ8WTU2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SSC4DQ8WTU2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSC4DQ8WTU2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSC4DQ8WTU2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSC4DQ8WTU2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSC4DQ8WTU2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSC4DQ8WTU2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSC4DQ8WTU2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSC4DQ8WTU2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SSC4DQ8WTU2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSC4DQ8WTU2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SSC4DQ8WTU2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSC4DQ8WTU2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSC4DQ8WTU2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSC4DQ8WTU2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SSC4DQ8WTU2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSC4DQ8WTU2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSC4DQ8WTU2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSC4DQ8WTU2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSC4DQ8WTU2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSC4DQ8WTU2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SSC4DQ8WTU2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSC4DQ8WTU2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SSC4DQ8WTU2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSC4DQ8WTU2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSC4DQ8WTU2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSC4DQ8WTU2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSC4DQ8WTU2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSC4DQ8WTU2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSC4DQ8WTU2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSC4DQ8WTU2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSC4DQ8WTU2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSC4DQ8WTU2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSC4DQ8WTU2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSC4DQ8WTU2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSC4DQ8WTU2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSC4DQ8WTU2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSC4DQ8WTU2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SSC4DQ8WTU2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSC4DQ8WTU2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSC4DQ8WTU2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSC4DQ8WTU2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSC4DQ8WTU2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSC4DQ8WTU2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSC4DQ8WTU2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSC4DQ8WTU2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSC4DQ8WTU2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSC4DQ8WTU2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSC4DQ8WTU2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSC4DQ8WTU2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSC4DQ8WTU2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSC4DQ8WTU2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSC4DQ8WTU2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSC4DQ8WTU2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSC4DQ8WTU2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSC4DQ8WTU2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSC4DQ8WTU2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSC4DQ8WTU2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSC4DQ8WTU2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSC4DQ8WTU2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSC4DQ8WTU2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSC4DQ8WTU2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSC4DQ8WTU2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSC4DQ8WTU2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSC4DQ8WTU2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSC4DQ8WTU2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSC4DQ8WTU2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SSC4DQ8WTU2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSC4DQ8WTU2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSC4DQ8WTU2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSC4DQ8WTU2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSC4DQ8WTU2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSC4DQ8WTU2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSC4DQ8WTU2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSC4DQ8WTU2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSC4DQ8WTU2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSC4DQ8WTU2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSC4DQ8WTU2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSC4DQ8WTU2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSC4DQ8WTU2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSC4DQ8WTU2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSC4DQ8WTU2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
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