Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBG9

SYNPR, Synaptoporin, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPRQ8TBG9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNPRQ8TBG9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNPRQ8TBG9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNPRQ8TBG9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPRQ8TBG9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNPRQ8TBG9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNPRQ8TBG9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPRQ8TBG9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPRQ8TBG9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPRQ8TBG9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPRQ8TBG9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNPRQ8TBG9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNPRQ8TBG9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNPRQ8TBG9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPRQ8TBG9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPRQ8TBG9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPRQ8TBG9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNPRQ8TBG9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPRQ8TBG9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNPRQ8TBG9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPRQ8TBG9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNPRQ8TBG9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPRQ8TBG9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNPRQ8TBG9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPRQ8TBG9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPRQ8TBG9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNPRQ8TBG9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNPRQ8TBG9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNPRQ8TBG9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNPRQ8TBG9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNPRQ8TBG9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNPRQ8TBG9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNPRQ8TBG9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNPRQ8TBG9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNPRQ8TBG9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNPRQ8TBG9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNPRQ8TBG9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNPRQ8TBG9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNPRQ8TBG9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNPRQ8TBG9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNPRQ8TBG9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNPRQ8TBG9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNPRQ8TBG9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNPRQ8TBG9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNPRQ8TBG9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNPRQ8TBG9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNPRQ8TBG9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNPRQ8TBG9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNPRQ8TBG9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNPRQ8TBG9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNPRQ8TBG9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNPRQ8TBG9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPRQ8TBG9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPRQ8TBG9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPRQ8TBG9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPRQ8TBG9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNPRQ8TBG9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNPRQ8TBG9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNPRQ8TBG9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNPRQ8TBG9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNPRQ8TBG9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNPRQ8TBG9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNPRQ8TBG9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNPRQ8TBG9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNPRQ8TBG9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNPRQ8TBG9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPRQ8TBG9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNPRQ8TBG9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPRQ8TBG9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPRQ8TBG9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPRQ8TBG9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPRQ8TBG9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNPRQ8TBG9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPRQ8TBG9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPRQ8TBG9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPRQ8TBG9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPRQ8TBG9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPRQ8TBG9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPRQ8TBG9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPRQ8TBG9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPRQ8TBG9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPRQ8TBG9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPRQ8TBG9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPRQ8TBG9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPRQ8TBG9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPRQ8TBG9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPRQ8TBG9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPRQ8TBG9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNPRQ8TBG9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPRQ8TBG9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPRQ8TBG9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPRQ8TBG9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPRQ8TBG9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPRQ8TBG9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPRQ8TBG9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPRQ8TBG9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPRQ8TBG9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPRQ8TBG9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPRQ8TBG9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPRQ8TBG9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms