Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZFP28Q8NHY6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ZFP28Q8NHY6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZFP28Q8NHY6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZFP28Q8NHY6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZFP28Q8NHY6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZFP28Q8NHY6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZFP28Q8NHY6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZFP28Q8NHY6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZFP28Q8NHY6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZFP28Q8NHY6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZFP28Q8NHY6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZFP28Q8NHY6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZFP28Q8NHY6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZFP28Q8NHY6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZFP28Q8NHY6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZFP28Q8NHY6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZFP28Q8NHY6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZFP28Q8NHY6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZFP28Q8NHY6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZFP28Q8NHY6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZFP28Q8NHY6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZFP28Q8NHY6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZFP28Q8NHY6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZFP28Q8NHY6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZFP28Q8NHY6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZFP28Q8NHY6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZFP28Q8NHY6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZFP28Q8NHY6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZFP28Q8NHY6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZFP28Q8NHY6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZFP28Q8NHY6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZFP28Q8NHY6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZFP28Q8NHY6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZFP28Q8NHY6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZFP28Q8NHY6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZFP28Q8NHY6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZFP28Q8NHY6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZFP28Q8NHY6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZFP28Q8NHY6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZFP28Q8NHY6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZFP28Q8NHY6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZFP28Q8NHY6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZFP28Q8NHY6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZFP28Q8NHY6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZFP28Q8NHY6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZFP28Q8NHY6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZFP28Q8NHY6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFP28Q8NHY6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFP28Q8NHY6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFP28Q8NHY6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZFP28Q8NHY6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZFP28Q8NHY6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFP28Q8NHY6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFP28Q8NHY6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFP28Q8NHY6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFP28Q8NHY6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFP28Q8NHY6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFP28Q8NHY6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFP28Q8NHY6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFP28Q8NHY6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFP28Q8NHY6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZFP28Q8NHY6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZFP28Q8NHY6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZFP28Q8NHY6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZFP28Q8NHY6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZFP28Q8NHY6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZFP28Q8NHY6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFP28Q8NHY6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZFP28Q8NHY6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZFP28Q8NHY6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZFP28Q8NHY6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFP28Q8NHY6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZFP28Q8NHY6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZFP28Q8NHY6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZFP28Q8NHY6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFP28Q8NHY6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFP28Q8NHY6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFP28Q8NHY6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZFP28Q8NHY6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZFP28Q8NHY6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZFP28Q8NHY6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFP28Q8NHY6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFP28Q8NHY6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZFP28Q8NHY6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFP28Q8NHY6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFP28Q8NHY6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFP28Q8NHY6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFP28Q8NHY6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFP28Q8NHY6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFP28Q8NHY6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZFP28Q8NHY6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZFP28Q8NHY6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZFP28Q8NHY6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFP28Q8NHY6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFP28Q8NHY6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFP28Q8NHY6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZFP28Q8NHY6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZFP28Q8NHY6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFP28Q8NHY6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms