Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EHBP1Q8NDI1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EHBP1Q8NDI1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EHBP1Q8NDI1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EHBP1Q8NDI1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EHBP1Q8NDI1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EHBP1Q8NDI1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EHBP1Q8NDI1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EHBP1Q8NDI1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EHBP1Q8NDI1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EHBP1Q8NDI1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EHBP1Q8NDI1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EHBP1Q8NDI1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EHBP1Q8NDI1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EHBP1Q8NDI1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EHBP1Q8NDI1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EHBP1Q8NDI1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EHBP1Q8NDI1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EHBP1Q8NDI1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EHBP1Q8NDI1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EHBP1Q8NDI1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
EHBP1Q8NDI1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
EHBP1Q8NDI1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
EHBP1Q8NDI1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EHBP1Q8NDI1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EHBP1Q8NDI1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EHBP1Q8NDI1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EHBP1Q8NDI1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EHBP1Q8NDI1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
EHBP1Q8NDI1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EHBP1Q8NDI1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms