Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POMGNT2Q8NAT1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POMGNT2Q8NAT1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POMGNT2Q8NAT1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POMGNT2Q8NAT1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POMGNT2Q8NAT1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POMGNT2Q8NAT1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POMGNT2Q8NAT1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POMGNT2Q8NAT1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POMGNT2Q8NAT1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POMGNT2Q8NAT1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POMGNT2Q8NAT1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POMGNT2Q8NAT1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POMGNT2Q8NAT1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMGNT2Q8NAT1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POMGNT2Q8NAT1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POMGNT2Q8NAT1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POMGNT2Q8NAT1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POMGNT2Q8NAT1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POMGNT2Q8NAT1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POMGNT2Q8NAT1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POMGNT2Q8NAT1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POMGNT2Q8NAT1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POMGNT2Q8NAT1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POMGNT2Q8NAT1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POMGNT2Q8NAT1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POMGNT2Q8NAT1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POMGNT2Q8NAT1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POMGNT2Q8NAT1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POMGNT2Q8NAT1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POMGNT2Q8NAT1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POMGNT2Q8NAT1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POMGNT2Q8NAT1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POMGNT2Q8NAT1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POMGNT2Q8NAT1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POMGNT2Q8NAT1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POMGNT2Q8NAT1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POMGNT2Q8NAT1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POMGNT2Q8NAT1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POMGNT2Q8NAT1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POMGNT2Q8NAT1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POMGNT2Q8NAT1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POMGNT2Q8NAT1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POMGNT2Q8NAT1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POMGNT2Q8NAT1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POMGNT2Q8NAT1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POMGNT2Q8NAT1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POMGNT2Q8NAT1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POMGNT2Q8NAT1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POMGNT2Q8NAT1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POMGNT2Q8NAT1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMGNT2Q8NAT1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMGNT2Q8NAT1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMGNT2Q8NAT1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POMGNT2Q8NAT1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMGNT2Q8NAT1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMGNT2Q8NAT1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POMGNT2Q8NAT1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POMGNT2Q8NAT1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMGNT2Q8NAT1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMGNT2Q8NAT1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMGNT2Q8NAT1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMGNT2Q8NAT1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMGNT2Q8NAT1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMGNT2Q8NAT1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMGNT2Q8NAT1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POMGNT2Q8NAT1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POMGNT2Q8NAT1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POMGNT2Q8NAT1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMGNT2Q8NAT1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POMGNT2Q8NAT1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POMGNT2Q8NAT1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POMGNT2Q8NAT1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POMGNT2Q8NAT1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POMGNT2Q8NAT1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POMGNT2Q8NAT1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POMGNT2Q8NAT1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POMGNT2Q8NAT1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POMGNT2Q8NAT1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POMGNT2Q8NAT1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms