Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7B6

PACRGL, PACRG-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACRGLQ8N7B6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PACRGLQ8N7B6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACRGLQ8N7B6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACRGLQ8N7B6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACRGLQ8N7B6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACRGLQ8N7B6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACRGLQ8N7B6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACRGLQ8N7B6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACRGLQ8N7B6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACRGLQ8N7B6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACRGLQ8N7B6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACRGLQ8N7B6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACRGLQ8N7B6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACRGLQ8N7B6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACRGLQ8N7B6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACRGLQ8N7B6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACRGLQ8N7B6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACRGLQ8N7B6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACRGLQ8N7B6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACRGLQ8N7B6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACRGLQ8N7B6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACRGLQ8N7B6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACRGLQ8N7B6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PACRGLQ8N7B6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACRGLQ8N7B6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACRGLQ8N7B6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACRGLQ8N7B6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACRGLQ8N7B6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACRGLQ8N7B6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACRGLQ8N7B6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PACRGLQ8N7B6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PACRGLQ8N7B6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PACRGLQ8N7B6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PACRGLQ8N7B6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACRGLQ8N7B6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACRGLQ8N7B6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACRGLQ8N7B6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACRGLQ8N7B6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACRGLQ8N7B6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PACRGLQ8N7B6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PACRGLQ8N7B6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PACRGLQ8N7B6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PACRGLQ8N7B6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PACRGLQ8N7B6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PACRGLQ8N7B6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PACRGLQ8N7B6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PACRGLQ8N7B6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PACRGLQ8N7B6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PACRGLQ8N7B6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PACRGLQ8N7B6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PACRGLQ8N7B6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PACRGLQ8N7B6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PACRGLQ8N7B6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PACRGLQ8N7B6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PACRGLQ8N7B6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PACRGLQ8N7B6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PACRGLQ8N7B6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PACRGLQ8N7B6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PACRGLQ8N7B6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PACRGLQ8N7B6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACRGLQ8N7B6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACRGLQ8N7B6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACRGLQ8N7B6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACRGLQ8N7B6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PACRGLQ8N7B6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACRGLQ8N7B6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACRGLQ8N7B6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACRGLQ8N7B6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PACRGLQ8N7B6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PACRGLQ8N7B6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PACRGLQ8N7B6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PACRGLQ8N7B6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PACRGLQ8N7B6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PACRGLQ8N7B6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PACRGLQ8N7B6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PACRGLQ8N7B6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PACRGLQ8N7B6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PACRGLQ8N7B6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PACRGLQ8N7B6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACRGLQ8N7B6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACRGLQ8N7B6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACRGLQ8N7B6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACRGLQ8N7B6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACRGLQ8N7B6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PACRGLQ8N7B6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PACRGLQ8N7B6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PACRGLQ8N7B6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PACRGLQ8N7B6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PACRGLQ8N7B6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PACRGLQ8N7B6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PACRGLQ8N7B6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PACRGLQ8N7B6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACRGLQ8N7B6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PACRGLQ8N7B6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PACRGLQ8N7B6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACRGLQ8N7B6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACRGLQ8N7B6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PACRGLQ8N7B6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PACRGLQ8N7B6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PACRGLQ8N7B6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms