Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4X5

AFAP1L2, Actin filament-associated protein 1-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFAP1L2Q8N4X5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AFAP1L2Q8N4X5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AFAP1L2Q8N4X5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AFAP1L2Q8N4X5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AFAP1L2Q8N4X5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AFAP1L2Q8N4X5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AFAP1L2Q8N4X5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AFAP1L2Q8N4X5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AFAP1L2Q8N4X5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AFAP1L2Q8N4X5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFAP1L2Q8N4X5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFAP1L2Q8N4X5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFAP1L2Q8N4X5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFAP1L2Q8N4X5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFAP1L2Q8N4X5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFAP1L2Q8N4X5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AFAP1L2Q8N4X5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AFAP1L2Q8N4X5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AFAP1L2Q8N4X5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFAP1L2Q8N4X5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFAP1L2Q8N4X5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFAP1L2Q8N4X5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AFAP1L2Q8N4X5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
AFAP1L2Q8N4X5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFAP1L2Q8N4X5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFAP1L2Q8N4X5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFAP1L2Q8N4X5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFAP1L2Q8N4X5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AFAP1L2Q8N4X5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AFAP1L2Q8N4X5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFAP1L2Q8N4X5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFAP1L2Q8N4X5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AFAP1L2Q8N4X5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AFAP1L2Q8N4X5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AFAP1L2Q8N4X5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AFAP1L2Q8N4X5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFAP1L2Q8N4X5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFAP1L2Q8N4X5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AFAP1L2Q8N4X5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AFAP1L2Q8N4X5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AFAP1L2Q8N4X5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AFAP1L2Q8N4X5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AFAP1L2Q8N4X5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFAP1L2Q8N4X5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFAP1L2Q8N4X5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFAP1L2Q8N4X5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFAP1L2Q8N4X5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFAP1L2Q8N4X5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFAP1L2Q8N4X5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFAP1L2Q8N4X5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFAP1L2Q8N4X5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFAP1L2Q8N4X5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFAP1L2Q8N4X5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFAP1L2Q8N4X5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFAP1L2Q8N4X5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFAP1L2Q8N4X5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
AFAP1L2Q8N4X5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFAP1L2Q8N4X5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AFAP1L2Q8N4X5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AFAP1L2Q8N4X5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AFAP1L2Q8N4X5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFAP1L2Q8N4X5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFAP1L2Q8N4X5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFAP1L2Q8N4X5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFAP1L2Q8N4X5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFAP1L2Q8N4X5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFAP1L2Q8N4X5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFAP1L2Q8N4X5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFAP1L2Q8N4X5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFAP1L2Q8N4X5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFAP1L2Q8N4X5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFAP1L2Q8N4X5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFAP1L2Q8N4X5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFAP1L2Q8N4X5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
AFAP1L2Q8N4X5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFAP1L2Q8N4X5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFAP1L2Q8N4X5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFAP1L2Q8N4X5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFAP1L2Q8N4X5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFAP1L2Q8N4X5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFAP1L2Q8N4X5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFAP1L2Q8N4X5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFAP1L2Q8N4X5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFAP1L2Q8N4X5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFAP1L2Q8N4X5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFAP1L2Q8N4X5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFAP1L2Q8N4X5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
AFAP1L2Q8N4X5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFAP1L2Q8N4X5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFAP1L2Q8N4X5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFAP1L2Q8N4X5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFAP1L2Q8N4X5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFAP1L2Q8N4X5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AFAP1L2Q8N4X5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AFAP1L2Q8N4X5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFAP1L2Q8N4X5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFAP1L2Q8N4X5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFAP1L2Q8N4X5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFAP1L2Q8N4X5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFAP1L2Q8N4X5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms