Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXK0

PHC2, Polyhomeotic-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC2Q8IXK0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHC2Q8IXK0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHC2Q8IXK0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHC2Q8IXK0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHC2Q8IXK0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHC2Q8IXK0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHC2Q8IXK0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHC2Q8IXK0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHC2Q8IXK0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHC2Q8IXK0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHC2Q8IXK0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHC2Q8IXK0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHC2Q8IXK0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHC2Q8IXK0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHC2Q8IXK0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHC2Q8IXK0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHC2Q8IXK0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHC2Q8IXK0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms