Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXK0

PHC2, Polyhomeotic-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC2Q8IXK0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PHC2Q8IXK0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHC2Q8IXK0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PHC2Q8IXK0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHC2Q8IXK0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHC2Q8IXK0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHC2Q8IXK0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHC2Q8IXK0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHC2Q8IXK0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHC2Q8IXK0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHC2Q8IXK0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PHC2Q8IXK0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHC2Q8IXK0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHC2Q8IXK0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHC2Q8IXK0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHC2Q8IXK0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHC2Q8IXK0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHC2Q8IXK0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHC2Q8IXK0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHC2Q8IXK0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHC2Q8IXK0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PHC2Q8IXK0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PHC2Q8IXK0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHC2Q8IXK0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHC2Q8IXK0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHC2Q8IXK0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHC2Q8IXK0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHC2Q8IXK0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PHC2Q8IXK0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PHC2Q8IXK0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHC2Q8IXK0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHC2Q8IXK0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHC2Q8IXK0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHC2Q8IXK0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHC2Q8IXK0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHC2Q8IXK0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHC2Q8IXK0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHC2Q8IXK0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHC2Q8IXK0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHC2Q8IXK0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHC2Q8IXK0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHC2Q8IXK0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHC2Q8IXK0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHC2Q8IXK0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHC2Q8IXK0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHC2Q8IXK0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHC2Q8IXK0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHC2Q8IXK0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHC2Q8IXK0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHC2Q8IXK0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHC2Q8IXK0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHC2Q8IXK0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHC2Q8IXK0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHC2Q8IXK0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHC2Q8IXK0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHC2Q8IXK0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHC2Q8IXK0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHC2Q8IXK0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHC2Q8IXK0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHC2Q8IXK0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHC2Q8IXK0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHC2Q8IXK0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHC2Q8IXK0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHC2Q8IXK0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHC2Q8IXK0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHC2Q8IXK0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHC2Q8IXK0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHC2Q8IXK0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHC2Q8IXK0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHC2Q8IXK0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHC2Q8IXK0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHC2Q8IXK0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHC2Q8IXK0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHC2Q8IXK0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHC2Q8IXK0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHC2Q8IXK0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHC2Q8IXK0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHC2Q8IXK0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHC2Q8IXK0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHC2Q8IXK0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHC2Q8IXK0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHC2Q8IXK0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHC2Q8IXK0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHC2Q8IXK0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHC2Q8IXK0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHC2Q8IXK0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHC2Q8IXK0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHC2Q8IXK0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHC2Q8IXK0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHC2Q8IXK0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHC2Q8IXK0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHC2Q8IXK0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHC2Q8IXK0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHC2Q8IXK0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHC2Q8IXK0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHC2Q8IXK0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHC2Q8IXK0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHC2Q8IXK0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHC2Q8IXK0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHC2Q8IXK0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms