Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC71Q8IV32 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC71Q8IV32 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC71Q8IV32 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC71Q8IV32 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC71Q8IV32 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC71Q8IV32 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC71Q8IV32 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC71Q8IV32 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC71Q8IV32 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC71Q8IV32 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC71Q8IV32 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC71Q8IV32 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC71Q8IV32 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC71Q8IV32 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC71Q8IV32 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC71Q8IV32 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC71Q8IV32 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC71Q8IV32 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC71Q8IV32 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC71Q8IV32 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC71Q8IV32 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC71Q8IV32 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC71Q8IV32 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC71Q8IV32 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC71Q8IV32 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC71Q8IV32 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC71Q8IV32 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC71Q8IV32 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC71Q8IV32 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC71Q8IV32 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC71Q8IV32 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC71Q8IV32 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC71Q8IV32 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC71Q8IV32 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC71Q8IV32 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC71Q8IV32 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC71Q8IV32 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC71Q8IV32 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC71Q8IV32 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC71Q8IV32 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC71Q8IV32 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC71Q8IV32 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC71Q8IV32 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC71Q8IV32 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC71Q8IV32 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC71Q8IV32 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC71Q8IV32 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC71Q8IV32 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC71Q8IV32 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC71Q8IV32 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC71Q8IV32 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC71Q8IV32 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC71Q8IV32 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC71Q8IV32 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC71Q8IV32 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC71Q8IV32 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC71Q8IV32 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC71Q8IV32 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC71Q8IV32 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC71Q8IV32 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC71Q8IV32 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC71Q8IV32 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC71Q8IV32 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC71Q8IV32 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC71Q8IV32 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC71Q8IV32 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC71Q8IV32 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC71Q8IV32 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC71Q8IV32 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC71Q8IV32 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC71Q8IV32 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC71Q8IV32 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC71Q8IV32 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC71Q8IV32 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC71Q8IV32 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC71Q8IV32 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC71Q8IV32 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC71Q8IV32 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC71Q8IV32 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC71Q8IV32 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC71Q8IV32 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms