Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z794

KRT77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT77Q7Z794 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT77Q7Z794 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT77Q7Z794 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT77Q7Z794 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT77Q7Z794 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT77Q7Z794 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
KRT77Q7Z794 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT77Q7Z794 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT77Q7Z794 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT77Q7Z794 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT77Q7Z794 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT77Q7Z794 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT77Q7Z794 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT77Q7Z794 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT77Q7Z794 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT77Q7Z794 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT77Q7Z794 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT77Q7Z794 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT77Q7Z794 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT77Q7Z794 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT77Q7Z794 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT77Q7Z794 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT77Q7Z794 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT77Q7Z794 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT77Q7Z794 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT77Q7Z794 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT77Q7Z794 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT77Q7Z794 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT77Q7Z794 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT77Q7Z794 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT77Q7Z794 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT77Q7Z794 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT77Q7Z794 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT77Q7Z794 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT77Q7Z794 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT77Q7Z794 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT77Q7Z794 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT77Q7Z794 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT77Q7Z794 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT77Q7Z794 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT77Q7Z794 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT77Q7Z794 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT77Q7Z794 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT77Q7Z794 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT77Q7Z794 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT77Q7Z794 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT77Q7Z794 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT77Q7Z794 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT77Q7Z794 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT77Q7Z794 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT77Q7Z794 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT77Q7Z794 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT77Q7Z794 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT77Q7Z794 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT77Q7Z794 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT77Q7Z794 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT77Q7Z794 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT77Q7Z794 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT77Q7Z794 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT77Q7Z794 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT77Q7Z794 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT77Q7Z794 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT77Q7Z794 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT77Q7Z794 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT77Q7Z794 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT77Q7Z794 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT77Q7Z794 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT77Q7Z794 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT77Q7Z794 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT77Q7Z794 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.1 ms