Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KANK3Q6NY19 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KANK3Q6NY19 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KANK3Q6NY19 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KANK3Q6NY19 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KANK3Q6NY19 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KANK3Q6NY19 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
KANK3Q6NY19 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KANK3Q6NY19 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KANK3Q6NY19 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KANK3Q6NY19 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KANK3Q6NY19 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KANK3Q6NY19 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KANK3Q6NY19 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KANK3Q6NY19 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
KANK3Q6NY19 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
KANK3Q6NY19 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KANK3Q6NY19 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KANK3Q6NY19 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KANK3Q6NY19 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KANK3Q6NY19 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KANK3Q6NY19 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KANK3Q6NY19 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KANK3Q6NY19 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KANK3Q6NY19 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KANK3Q6NY19 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KANK3Q6NY19 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
KANK3Q6NY19 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
KANK3Q6NY19 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KANK3Q6NY19 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KANK3Q6NY19 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KANK3Q6NY19 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KANK3Q6NY19 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KANK3Q6NY19 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
KANK3Q6NY19 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
KANK3Q6NY19 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
KANK3Q6NY19 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
KANK3Q6NY19 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
KANK3Q6NY19 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KANK3Q6NY19 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KANK3Q6NY19 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KANK3Q6NY19 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KANK3Q6NY19 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KANK3Q6NY19 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
KANK3Q6NY19 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KANK3Q6NY19 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KANK3Q6NY19 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
KANK3Q6NY19 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KANK3Q6NY19 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KANK3Q6NY19 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KANK3Q6NY19 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KANK3Q6NY19 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KANK3Q6NY19 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KANK3Q6NY19 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KANK3Q6NY19 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KANK3Q6NY19 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KANK3Q6NY19 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
KANK3Q6NY19 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KANK3Q6NY19 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KANK3Q6NY19 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KANK3Q6NY19 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
KANK3Q6NY19 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
KANK3Q6NY19 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KANK3Q6NY19 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KANK3Q6NY19 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KANK3Q6NY19 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
KANK3Q6NY19 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
KANK3Q6NY19 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
KANK3Q6NY19 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KANK3Q6NY19 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KANK3Q6NY19 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KANK3Q6NY19 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
KANK3Q6NY19 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KANK3Q6NY19 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KANK3Q6NY19 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KANK3Q6NY19 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
KANK3Q6NY19 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
KANK3Q6NY19 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
KANK3Q6NY19 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KANK3Q6NY19 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KANK3Q6NY19 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KANK3Q6NY19 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KANK3Q6NY19 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KANK3Q6NY19 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KANK3Q6NY19 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KANK3Q6NY19 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KANK3Q6NY19 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KANK3Q6NY19 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KANK3Q6NY19 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KANK3Q6NY19 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KANK3Q6NY19 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KANK3Q6NY19 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KANK3Q6NY19 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KANK3Q6NY19 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
KANK3Q6NY19 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KANK3Q6NY19 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KANK3Q6NY19 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KANK3Q6NY19 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KANK3Q6NY19 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KANK3Q6NY19 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms